More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0475 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1063 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1063 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.7 
 
 		 1041 aa  690    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.86 
 
 		 1067 aa  685    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1063 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  36.11 
 
 		 1048 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.54 
 
 		 1052 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  36.19 
 
 		 1063 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1053 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  35.22 
 
 		 1055 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  38.19 
 
 		 1039 aa  675    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.18 
 
 		 1093 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1060 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  35.93 
 
 		 1044 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  35.79 
 
 		 1067 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1067 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1050 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1072 aa  2162    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  36.1 
 
 		 1067 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1063 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.59 
 
 		 1067 aa  711    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  35.88 
 
 		 1049 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1073 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 		 1069 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  35.95 
 
 		 1057 aa  621  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1061 aa  621  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 		 1060 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1052 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  35.98 
 
 		 1056 aa  614  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.92 
 
 		 1121 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.82 
 
 		 1074 aa  605  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  35.43 
 
 		 1050 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  36.71 
 
 		 1038 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1032 aa  595  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1060 aa  582  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1098 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 		 1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.02 
 
 		 1042 aa  512  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1068 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1053 aa  506  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  33.24 
 
 		 1075 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1053 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1034 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.8 
 
 		 1071 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1054 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1062 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1048 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1066 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1033 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  29.53 
 
 		 1048 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.98 
 
 		 1054 aa  439  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.25 
 
 		 1060 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1074 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1041 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1035 aa  429  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1040 aa  422  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1033 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1041 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.85 
 
 		 1034 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1030 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 		 1054 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1033 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1035 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1041 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1043 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1053 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1063 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27.09 
 
 		 1053 aa  393  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1036 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1064 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1050 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.36 
 
 		 1135 aa  361  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1131 aa  349  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1137 aa  333  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1038 aa  325  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1011 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1035 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1092 aa  317  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1055 aa  313  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1043 aa  303  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1030 aa  301  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.89 
 
 		 1191 aa  300  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.2 
 
 		 1053 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.05 
 
 		 1069 aa  298  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  24.85 
 
 		 1134 aa  298  5e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1043 aa  296  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1058 aa  296  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  23.24 
 
 		 1057 aa  294  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.8 
 
 		 1050 aa  293  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1034 aa  294  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1088 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1022 aa  290  7e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  26.9 
 
 		 1088 aa  288  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1030 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1088 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1031 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1034 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1071 aa  284  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1070 aa  283  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1031 aa  283  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>