More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3095 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  44.64 
 
 		 1053 aa  917    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  44.58 
 
 		 1063 aa  931    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  45.2 
 
 		 1049 aa  926    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.89 
 
 		 1074 aa  1150    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  44.49 
 
 		 1050 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.99 
 
 		 1041 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.51 
 
 		 1067 aa  920    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.8 
 
 		 1052 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  44.68 
 
 		 1063 aa  932    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  44.19 
 
 		 1048 aa  942    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1063 aa  934    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  38.94 
 
 		 1039 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1093 aa  2227    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  43.67 
 
 		 1056 aa  857    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  55.42 
 
 		 1060 aa  1147    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  54.08 
 
 		 1060 aa  1175    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  43.09 
 
 		 1044 aa  866    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  44.14 
 
 		 1069 aa  911    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  43.89 
 
 		 1052 aa  887    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1063 aa  934    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  45.18 
 
 		 1067 aa  936    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  54.34 
 
 		 1073 aa  1168    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  45.32 
 
 		 1067 aa  937    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  44.51 
 
 		 1050 aa  916    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  54.29 
 
 		 1061 aa  1166    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  43.81 
 
 		 1055 aa  920    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  55.81 
 
 		 1057 aa  1191    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  45.23 
 
 		 1067 aa  931    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  54.33 
 
 		 1060 aa  1165    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1063 aa  934    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.93 
 
 		 1067 aa  926    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1072 aa  631  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 		 1121 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1068 aa  625  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1032 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1038 aa  595  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1053 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1062 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.58 
 
 		 1042 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1066 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1051 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1034 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.79 
 
 		 1060 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1098 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.69 
 
 		 1053 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1033 aa  492  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.54 
 
 		 1075 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1041 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.02 
 
 		 1048 aa  482  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1054 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1053 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1048 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1041 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 		 1033 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1074 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1040 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  30.37 
 
 		 1071 aa  446  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.28 
 
 		 1034 aa  439  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1050 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1054 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1035 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1030 aa  436  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1036 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.3 
 
 		 1054 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1053 aa  426  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1041 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1063 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1043 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1035 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1064 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1035 aa  356  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  27.99 
 
 		 1135 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1131 aa  344  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1030 aa  336  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1137 aa  327  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1050 aa  320  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.36 
 
 		 1005 aa  319  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1056 aa  304  5.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1064 aa  292  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1044 aa  292  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1017 aa  283  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.18 
 
 		 1092 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  24.08 
 
 		 1088 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  23.6 
 
 		 1039 aa  280  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1046 aa  280  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1034 aa  277  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  23.48 
 
 		 1055 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  24.21 
 
 		 1088 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  24.26 
 
 		 1088 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1011 aa  272  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.83 
 
 		 1049 aa  272  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1034 aa  270  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1044 aa  269  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1146 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1043 aa  268  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  23.82 
 
 		 1040 aa  268  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  23.79 
 
 		 1043 aa  267  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1043 aa  266  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1038 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>