More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0270 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1039 aa  2081    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1044 aa  663    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.26 
 
 		 1005 aa  703    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1033 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.17 
 
 		 1034 aa  327  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  25 
 
 		 1033 aa  323  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1035 aa  321  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1054 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  24.31 
 
 		 1030 aa  316  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1036 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1041 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1063 aa  307  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  24.32 
 
 		 1044 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  24.51 
 
 		 1063 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1053 aa  305  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  23.44 
 
 		 1040 aa  305  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  25.34 
 
 		 1039 aa  305  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 		 1063 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.81 
 
 		 1067 aa  303  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  24.32 
 
 		 1063 aa  302  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1041 aa  299  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1067 aa  297  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  24.38 
 
 		 1042 aa  296  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  24.58 
 
 		 1067 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  24.58 
 
 		 1067 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1054 aa  294  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  23.85 
 
 		 1048 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1055 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  23.41 
 
 		 1050 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1052 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.6 
 
 		 1093 aa  291  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1048 aa  289  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  23.55 
 
 		 1050 aa  287  5.999999999999999e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  23.77 
 
 		 1063 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.63 
 
 		 1041 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  23.59 
 
 		 1033 aa  286  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.16 
 
 		 1067 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  24 
 
 		 1049 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  24.08 
 
 		 1052 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1063 aa  281  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  22.77 
 
 		 1121 aa  281  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1053 aa  280  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1069 aa  279  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  23.83 
 
 		 1053 aa  278  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  23.62 
 
 		 1032 aa  278  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  24.22 
 
 		 1064 aa  277  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  24.15 
 
 		 1034 aa  277  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  23.56 
 
 		 1051 aa  275  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  24.76 
 
 		 1048 aa  274  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  23.28 
 
 		 1050 aa  274  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  23.15 
 
 		 1043 aa  271  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.92 
 
 		 1074 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  23.31 
 
 		 1069 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  23.85 
 
 		 1045 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1053 aa  264  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  24.27 
 
 		 1068 aa  263  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  23.14 
 
 		 1048 aa  259  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.14 
 
 		 1054 aa  258  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  23.13 
 
 		 1057 aa  254  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  23.86 
 
 		 1025 aa  253  1e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.07 
 
 		 1023 aa  251  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  21.74 
 
 		 1060 aa  250  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  23.17 
 
 		 1043 aa  250  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  24.11 
 
 		 1035 aa  250  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  24.04 
 
 		 1068 aa  248  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  23.28 
 
 		 1043 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  21.62 
 
 		 1073 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  22.7 
 
 		 1131 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  23.25 
 
 		 1041 aa  245  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.02 
 
 		 1060 aa  245  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  22.65 
 
 		 1052 aa  243  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  23.56 
 
 		 1048 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1011 aa  243  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1030 aa  243  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  23.53 
 
 		 1058 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.06 
 
 		 1056 aa  241  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  24.58 
 
 		 1024 aa  240  9e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  22.18 
 
 		 1034 aa  240  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  22.91 
 
 		 1060 aa  240  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  23.04 
 
 		 1057 aa  239  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  22.3 
 
 		 1029 aa  237  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  22.94 
 
 		 1017 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  22.36 
 
 		 1072 aa  236  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  24.03 
 
 		 1022 aa  235  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  23.26 
 
 		 1050 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1032 aa  234  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1049 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  21.51 
 
 		 1061 aa  231  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  21.66 
 
 		 1060 aa  230  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  23.69 
 
 		 1038 aa  229  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 		 1029 aa  230  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  22.52 
 
 		 1074 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  22.54 
 
 		 1053 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  22.63 
 
 		 1051 aa  229  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1057 aa  228  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  21.86 
 
 		 1024 aa  227  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  23.12 
 
 		 1034 aa  226  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  22.79 
 
 		 1033 aa  226  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  22.84 
 
 		 1030 aa  225  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  23.69 
 
 		 1048 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>