More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0243 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  53.04 
 
 		 1053 aa  1031    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1054 aa  2135    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  45.7 
 
 		 1040 aa  893    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  52.09 
 
 		 1043 aa  1086    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  48.91 
 
 		 1074 aa  992    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  49.62 
 
 		 1064 aa  1000    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  50.87 
 
 		 1050 aa  1035    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1041 aa  555  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1033 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  32 
 
 		 1042 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1048 aa  539  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.56 
 
 		 1041 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  32.9 
 
 		 1039 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1121 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1067 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1049 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  31.92 
 
 		 1044 aa  532  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1067 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1067 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1063 aa  526  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  31.26 
 
 		 1052 aa  525  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1131 aa  525  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.42 
 
 		 1034 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1063 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1053 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1063 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1063 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1063 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 		 1067 aa  515  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.89 
 
 		 1067 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1033 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1055 aa  512  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1035 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1036 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1041 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1069 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 1062 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1068 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1050 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  30.64 
 
 		 1050 aa  492  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1032 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1052 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1137 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1060 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1057 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  33.24 
 
 		 1135 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1034 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1073 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1053 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.11 
 
 		 1054 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1060 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1063 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1030 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.53 
 
 		 1056 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1035 aa  459  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1038 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1061 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.46 
 
 		 1074 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1051 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1041 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1033 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.34 
 
 		 1093 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.24 
 
 		 1075 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1053 aa  444  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1060 aa  432  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1066 aa  429  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1048 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  29.1 
 
 		 1048 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  29.01 
 
 		 1071 aa  419  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1054 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.91 
 
 		 1060 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1072 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  26.29 
 
 		 1053 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1044 aa  366  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1044 aa  355  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1035 aa  356  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1034 aa  353  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.6 
 
 		 1005 aa  335  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1034 aa  334  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1030 aa  330  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1043 aa  328  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1043 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 		 1098 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1044 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1040 aa  315  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1039 aa  313  7.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1039 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1038 aa  311  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1050 aa  310  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1023 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1043 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.89 
 
 		 1011 aa  305  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1092 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.68 
 
 		 1036 aa  300  7e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1030 aa  300  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.59 
 
 		 1049 aa  298  5e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1034 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1046 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  24.57 
 
 		 1041 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1055 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>