More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1499 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1039 aa  716    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  39.72 
 
 		 1044 aa  761    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  100 
 
 		 1005 aa  1999    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1033 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1074 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  26.97 
 
 		 1039 aa  342  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.26 
 
 		 1041 aa  341  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1054 aa  340  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1033 aa  340  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1048 aa  336  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1067 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1067 aa  333  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1053 aa  332  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1067 aa  332  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1043 aa  331  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.64 
 
 		 1093 aa  331  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1036 aa  330  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1121 aa  330  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1035 aa  330  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.95 
 
 		 1067 aa  326  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1063 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1063 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1063 aa  325  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1040 aa  324  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1050 aa  323  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  25.87 
 
 		 1052 aa  323  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.43 
 
 		 1067 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  27.7 
 
 		 1075 aa  323  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1050 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1063 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1055 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  24.59 
 
 		 1044 aa  311  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1063 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1041 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1041 aa  309  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1060 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1063 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1049 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1069 aa  307  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1033 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1038 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1032 aa  302  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1053 aa  300  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1034 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  25.7 
 
 		 1034 aa  298  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1035 aa  296  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1064 aa  295  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  25.68 
 
 		 1050 aa  294  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.26 
 
 		 1074 aa  294  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1051 aa  294  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1030 aa  293  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 		 1060 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  25.12 
 
 		 1042 aa  291  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.58 
 
 		 1054 aa  288  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1057 aa  287  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1052 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  26.63 
 
 		 1048 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1061 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1073 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1041 aa  282  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  25.41 
 
 		 1056 aa  280  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1053 aa  279  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1048 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1060 aa  273  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1044 aa  269  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1040 aa  269  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1058 aa  268  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1053 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 		 1023 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  24.23 
 
 		 1053 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.55 
 
 		 1060 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  26.13 
 
 		 1071 aa  263  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  24.68 
 
 		 1072 aa  261  6e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1063 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1043 aa  258  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1035 aa  257  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  24.39 
 
 		 1043 aa  257  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1054 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1092 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1038 aa  255  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  23.65 
 
 		 1057 aa  255  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1048 aa  253  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1011 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1058 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  22.37 
 
 		 1006 aa  252  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  23.73 
 
 		 1029 aa  248  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1069 aa  247  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  24.77 
 
 		 1042 aa  247  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1057 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  24.48 
 
 		 1068 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1034 aa  246  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1009 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5382  acriflavin resistance protein  23.29 
 
 		 1095 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651805  normal  0.619486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  23.87 
 
 		 1059 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  23.14 
 
 		 1036 aa  244  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1030 aa  241  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  23.47 
 
 		 1014 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1056 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  23.58 
 
 		 1045 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  24.04 
 
 		 1044 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>