More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0308 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1050 aa  2100    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  53.05 
 
 
1053 aa  1050    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  50.87 
 
 
1054 aa  1046    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  55.36 
 
 
1043 aa  1102    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  51.04 
 
 
1074 aa  1026    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  48.11 
 
 
1040 aa  926    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  54.28 
 
 
1064 aa  1037    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.4 
 
 
1052 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1063 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  32.82 
 
 
1044 aa  567  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 
1067 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 
1121 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 
1067 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 
1049 aa  562  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.49 
 
 
1067 aa  561  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1053 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 
1063 aa  562  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 
1063 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 
1063 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 
1063 aa  562  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 
1067 aa  562  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 
1048 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.98 
 
 
1041 aa  555  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 
1055 aa  554  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.49 
 
 
1042 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1032 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 
1137 aa  539  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 
1038 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 
1131 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.25 
 
 
1067 aa  535  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 
1050 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  32.8 
 
 
1039 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  34.52 
 
 
1135 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 
1051 aa  506  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 
1034 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 
1033 aa  492  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1062 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 
1057 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 
1033 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 
1041 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.21 
 
 
1033 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 
1068 aa  483  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 
1035 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1030 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 
1073 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1060 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
1041 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1069 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  29.68 
 
 
1050 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1053 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30 
 
 
1035 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 
1053 aa  463  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.67 
 
 
1075 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29 
 
 
1041 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.73 
 
 
1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.09 
 
 
1052 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.95 
 
 
1054 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 
1066 aa  459  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.22 
 
 
1074 aa  456  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 
1060 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 
1054 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  27.45 
 
 
1056 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.3 
 
 
1093 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 
1063 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 
1048 aa  446  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 
1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.2 
 
 
1048 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1061 aa  439  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 
1060 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.6 
 
 
1060 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  30.09 
 
 
1071 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 
1043 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27 
 
 
1053 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.1 
 
 
1036 aa  366  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 
1072 aa  360  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1025 aa  349  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  23.66 
 
 
1044 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 
1034 aa  343  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 
1043 aa  340  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 
1050 aa  337  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 
1038 aa  336  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 
1098 aa  334  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  28.75 
 
 
1042 aa  333  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 
1030 aa  332  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 
1044 aa  331  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 
1035 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 
1046 aa  326  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 
1092 aa  327  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 
1041 aa  325  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 
1025 aa  324  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 
1040 aa  324  6e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1048 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  24.59 
 
 
1005 aa  323  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.95 
 
 
1052 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 
1011 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.62 
 
 
1049 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 
1028 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 
1191 aa  317  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1055 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 
1043 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>