More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3677 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1048 aa  674    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1063 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1073 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.31 
 
 		 1041 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.07 
 
 		 1067 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 		 1055 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  38.31 
 
 		 1063 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  62.12 
 
 		 1062 aa  1330    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  38.31 
 
 		 1063 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1067 aa  694    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1057 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1060 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.26 
 
 		 1067 aa  666    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 		 1063 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 		 1053 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  62.04 
 
 		 1068 aa  1340    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  38.5 
 
 		 1044 aa  686    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  37.68 
 
 		 1067 aa  694    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  49.43 
 
 		 1066 aa  999    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1063 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  37.86 
 
 		 1067 aa  695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1060 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  37.04 
 
 		 1050 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  35.26 
 
 		 1061 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1053 aa  2146    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  37.27 
 
 		 1049 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.82 
 
 		 1074 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  34.61 
 
 		 1060 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1121 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.75 
 
 		 1052 aa  591  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  35.13 
 
 		 1039 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.97 
 
 		 1093 aa  591  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.95 
 
 		 1056 aa  571  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1032 aa  562  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1051 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  32.13 
 
 		 1050 aa  554  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1069 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1052 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  32.08 
 
 		 1042 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1038 aa  532  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.58 
 
 		 1075 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  31.08 
 
 		 1053 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1053 aa  492  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.52 
 
 		 1048 aa  485  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1054 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.62 
 
 		 1071 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1034 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1074 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1041 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1098 aa  466  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1072 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.02 
 
 		 1054 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.75 
 
 		 1060 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1033 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1054 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1033 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1048 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1041 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1036 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1050 aa  446  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1041 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1030 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.4 
 
 		 1034 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1064 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1035 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1043 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1053 aa  428  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1063 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1033 aa  389  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1035 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.16 
 
 		 1135 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1137 aa  356  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1035 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1056 aa  296  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1064 aa  284  6.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1044 aa  282  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1038 aa  281  6e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.44 
 
 		 1057 aa  280  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1044 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1043 aa  275  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1470 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1044 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1031 aa  268  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  24.09 
 
 		 1041 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  24.31 
 
 		 1032 aa  266  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1043 aa  264  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1034 aa  264  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1039 aa  264  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.57 
 
 		 1052 aa  263  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.68 
 
 		 1092 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 1496 aa  259  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.28 
 
 		 1043 aa  259  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1055 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.86 
 
 		 1046 aa  258  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  23.81 
 
 		 1005 aa  255  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1057 aa  253  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1026 aa  252  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  24.01 
 
 		 1042 aa  253  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>