More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1969 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  54.51 
 
 
1056 aa  1118    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1064 aa  2135    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  53.25 
 
 
1057 aa  1105    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 
1035 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 
1030 aa  552  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 
1055 aa  413  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 
1053 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 
1063 aa  412  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 
1063 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.01 
 
 
1067 aa  406  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 
1063 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 
1063 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 
1063 aa  406  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 
1033 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 
1048 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 
1067 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 
1067 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 
1067 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 
1050 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  26.56 
 
 
1044 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  27.6 
 
 
1039 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.41 
 
 
1041 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 
1049 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.2 
 
 
1067 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  25.57 
 
 
1052 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.97 
 
 
1034 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 
1035 aa  364  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 
1041 aa  358  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 
1032 aa  355  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 
1063 aa  353  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 
1011 aa  352  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  26.16 
 
 
1033 aa  352  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 
1074 aa  352  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 
1041 aa  351  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  24.74 
 
 
1052 aa  351  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.77 
 
 
1093 aa  350  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 
1043 aa  349  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 
1038 aa  347  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 
1053 aa  347  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  26.92 
 
 
1075 aa  347  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 
1121 aa  345  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.3 
 
 
1042 aa  345  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 
1034 aa  342  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 
1050 aa  341  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.31 
 
 
1074 aa  340  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 
1040 aa  339  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 
1036 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 
1069 aa  337  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 
1068 aa  333  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 
1043 aa  332  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  23.63 
 
 
1050 aa  331  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 
1033 aa  331  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 
1043 aa  331  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.55 
 
 
1024 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 
1073 aa  331  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 
1044 aa  331  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 
1044 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  24.12 
 
 
1025 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 
1057 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 
1064 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 
1060 aa  327  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  23.63 
 
 
1054 aa  325  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 
1092 aa  325  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 
1034 aa  323  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 
1053 aa  323  9.000000000000001e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 
1060 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 
1146 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  24.84 
 
 
1062 aa  319  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  24.67 
 
 
1061 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 
1041 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  24.58 
 
 
1060 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 
1040 aa  313  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 
1038 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 
1043 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 
1070 aa  309  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  23.67 
 
 
1056 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 
1028 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 
1050 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  23.73 
 
 
1025 aa  305  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  23.24 
 
 
1030 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.59 
 
 
1050 aa  303  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 
1065 aa  303  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 
1028 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 
1028 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  24.48 
 
 
1072 aa  303  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  24.34 
 
 
1071 aa  303  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  24.31 
 
 
1054 aa  302  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.07 
 
 
1054 aa  301  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  26.19 
 
 
1053 aa  301  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 
1023 aa  301  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.43 
 
 
1068 aa  300  8e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  23.26 
 
 
1053 aa  300  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 
1048 aa  299  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 
1143 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.72 
 
 
1034 aa  298  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 
1044 aa  297  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  24.31 
 
 
1051 aa  297  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  25.21 
 
 
1048 aa  296  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 
1055 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.28 
 
 
1055 aa  295  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>