More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01595 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  45.96 
 
 		 1053 aa  943    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  100 
 
 		 1071 aa  2144    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  43.8 
 
 		 1048 aa  866    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  45.43 
 
 		 1054 aa  930    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  43.98 
 
 		 1048 aa  872    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.22 
 
 		 1052 aa  618  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.09 
 
 		 1067 aa  602  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  34.68 
 
 		 1039 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1063 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1063 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1063 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1063 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  34.54 
 
 		 1044 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1055 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1048 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1053 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1067 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1067 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.13 
 
 		 1067 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1067 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1063 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1050 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1032 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.4 
 
 		 1041 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1121 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1049 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1035 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1041 aa  539  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1069 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1033 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  32.9 
 
 		 1038 aa  529  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.45 
 
 		 1042 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1068 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1036 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  32.12 
 
 		 1050 aa  523  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1052 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.85 
 
 		 1074 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.09 
 
 		 1056 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1033 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 		 1060 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1041 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1060 aa  500  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1060 aa  499  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.46 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1066 aa  499  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1034 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1072 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1073 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1057 aa  493  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1063 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1062 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.66 
 
 		 1093 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1061 aa  482  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.01 
 
 		 1075 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1030 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1035 aa  453  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1074 aa  452  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.85 
 
 		 1060 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.84 
 
 		 1054 aa  446  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1054 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1050 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1033 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1098 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27.16 
 
 		 1053 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1040 aa  422  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1043 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1035 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1053 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1030 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1064 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1131 aa  373  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1034 aa  350  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1043 aa  348  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1044 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1011 aa  328  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.85 
 
 		 1134 aa  327  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1056 aa  323  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1057 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1092 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1137 aa  314  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.5 
 
 		 1191 aa  310  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  27.99 
 
 		 1135 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1033 aa  309  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.34 
 
 		 1036 aa  307  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1034 aa  306  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1025 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.63 
 
 		 1063 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1082 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1046 aa  304  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1043 aa  303  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  26.01 
 
 		 1165 aa  302  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.28 
 
 		 1024 aa  302  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.43 
 
 		 1050 aa  302  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  24.53 
 
 		 1051 aa  301  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.62 
 
 		 1049 aa  300  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1044 aa  300  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1065 aa  300  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>