More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4648 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  40.75 
 
 		 1049 aa  811    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.29 
 
 		 1074 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  41.27 
 
 		 1063 aa  846    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1041 aa  2084    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.9 
 
 		 1067 aa  826    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  41.27 
 
 		 1063 aa  847    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1060 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1073 aa  702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  41.27 
 
 		 1063 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  40.19 
 
 		 1055 aa  813    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  41.36 
 
 		 1052 aa  816    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  41.17 
 
 		 1063 aa  839    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1038 aa  727    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  41.22 
 
 		 1044 aa  804    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1034 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1057 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  63.78 
 
 		 1039 aa  1340    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.99 
 
 		 1093 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  37.21 
 
 		 1042 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  40.19 
 
 		 1053 aa  808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  37.13 
 
 		 1060 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  41.64 
 
 		 1121 aa  782    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  40.72 
 
 		 1032 aa  735    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  37.42 
 
 		 1069 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  41.2 
 
 		 1048 aa  853    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  41.27 
 
 		 1063 aa  847    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  37.88 
 
 		 1056 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  41.05 
 
 		 1067 aa  831    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  37.89 
 
 		 1060 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 		 1062 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  41.01 
 
 		 1067 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  40.73 
 
 		 1050 aa  828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  37.14 
 
 		 1061 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  38.31 
 
 		 1053 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 		 1072 aa  671    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 		 1051 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  40.82 
 
 		 1067 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.18 
 
 		 1067 aa  826    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 		 1068 aa  631  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  37.02 
 
 		 1050 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1052 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1053 aa  608  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  34.88 
 
 		 1075 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 		 1066 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34 
 
 		 1060 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1098 aa  572  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1074 aa  562  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  32.85 
 
 		 1053 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1050 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1043 aa  552  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  33.37 
 
 		 1071 aa  550  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 		 1040 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1033 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.07 
 
 		 1054 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  32.06 
 
 		 1048 aa  542  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1054 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1041 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1053 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1033 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 		 1064 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1054 aa  535  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 		 1035 aa  535  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1041 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1041 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1048 aa  529  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  32 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1030 aa  529  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.17 
 
 		 1034 aa  519  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1036 aa  502  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1063 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1035 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1043 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1044 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1131 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1034 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1137 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1092 aa  379  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1043 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1043 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1030 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1035 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1046 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1040 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.44 
 
 		 1135 aa  364  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1011 aa  363  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1044 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1055 aa  358  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.68 
 
 		 1049 aa  356  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1038 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1143 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1063 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.11 
 
 		 1036 aa  340  8e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1146 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.83 
 
 		 1134 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1191 aa  337  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1064 aa  337  9e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1059 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1058 aa  336  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1053 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>