More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1756 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  65.34 
 
 		 1033 aa  1386    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  64.18 
 
 		 1034 aa  1355    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  64.72 
 
 		 1063 aa  1407    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 		 1035 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  43.86 
 
 		 1033 aa  884    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  56.4 
 
 		 1041 aa  1230    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1041 aa  2105    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  40.87 
 
 		 1030 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  69.95 
 
 		 1035 aa  1466    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  68.92 
 
 		 1036 aa  1433    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.95 
 
 		 1052 aa  594  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1067 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1067 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1067 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1055 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1048 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1063 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1063 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.59 
 
 		 1067 aa  568  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1063 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1063 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1063 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1049 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.27 
 
 		 1067 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1053 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  32.31 
 
 		 1044 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1053 aa  539  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1050 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.84 
 
 		 1041 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1032 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1054 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1074 aa  522  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 		 1121 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.36 
 
 		 1071 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.78 
 
 		 1048 aa  497  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1048 aa  496  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1054 aa  495  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1051 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1040 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  30.57 
 
 		 1039 aa  492  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.04 
 
 		 1075 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1038 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1043 aa  475  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  29.95 
 
 		 1050 aa  475  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1033 aa  475  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1069 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1060 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1052 aa  469  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1034 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  29.15 
 
 		 1042 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1041 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.39 
 
 		 1054 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1061 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1073 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1050 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1098 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.18 
 
 		 1056 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1060 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1053 aa  446  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1057 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1064 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.6 
 
 		 1074 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1060 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.67 
 
 		 1060 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.37 
 
 		 1093 aa  423  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1062 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1068 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1035 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1072 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1030 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  26.96 
 
 		 1053 aa  396  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1066 aa  393  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1131 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.71 
 
 		 1135 aa  363  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1044 aa  345  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1043 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1137 aa  340  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.07 
 
 		 1057 aa  325  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1191 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1025 aa  317  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.73 
 
 		 1036 aa  317  9e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1011 aa  317  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1056 aa  316  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1050 aa  313  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1064 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.57 
 
 		 1044 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 		 1038 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.21 
 
 		 1069 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1034 aa  304  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.65 
 
 		 1070 aa  303  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  24.63 
 
 		 1095 aa  303  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1039 aa  303  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.15 
 
 		 1005 aa  301  4e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.01 
 
 		 1028 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1034 aa  300  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1025 aa  298  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  23.37 
 
 		 1044 aa  298  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  26.02 
 
 		 1165 aa  297  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1039 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>