More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0813 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  74.28 
 
 		 1054 aa  1556    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  65.23 
 
 		 1048 aa  1389    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1053 aa  2126    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  65.39 
 
 		 1048 aa  1389    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  45.96 
 
 		 1071 aa  915    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.11 
 
 		 1052 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.11 
 
 		 1041 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1055 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1063 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1048 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1063 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.98 
 
 		 1067 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1063 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1063 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1067 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.2 
 
 		 1067 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1063 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1067 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 		 1032 aa  598  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1053 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1067 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1050 aa  592  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1049 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  33.52 
 
 		 1044 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  34.44 
 
 		 1039 aa  570  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1121 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 		 1060 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 		 1060 aa  545  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1041 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 		 1038 aa  538  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1061 aa  539  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1035 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.36 
 
 		 1074 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1057 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1073 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1060 aa  524  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1068 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1036 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1034 aa  515  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  31.13 
 
 		 1050 aa  512  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1033 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1053 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.93 
 
 		 1034 aa  508  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1072 aa  502  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1063 aa  499  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.74 
 
 		 1093 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1052 aa  493  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1069 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.37 
 
 		 1056 aa  489  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1066 aa  486  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1041 aa  485  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1062 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1051 aa  483  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  28.53 
 
 		 1042 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1074 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.98 
 
 		 1053 aa  469  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.19 
 
 		 1054 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  30.73 
 
 		 1075 aa  462  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1030 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1033 aa  458  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1043 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1054 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1035 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1053 aa  436  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1040 aa  426  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1064 aa  419  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.3 
 
 		 1060 aa  412  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1098 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1030 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1035 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1131 aa  356  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1011 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1050 aa  343  9e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  29.33 
 
 		 1135 aa  341  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1044 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1137 aa  330  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1028 aa  330  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1044 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1025 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1028 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1043 aa  319  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1043 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1041 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1034 aa  314  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.04 
 
 		 1049 aa  313  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 		 1044 aa  310  6.999999999999999e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1031 aa  310  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1034 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1086 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1191 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1039 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.69 
 
 		 1036 aa  307  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1143 aa  307  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1046 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1063 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1039 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1009 aa  302  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>