More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4864 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.26 
 
 		 1060 aa  691    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.22 
 
 		 1041 aa  693    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.35 
 
 		 1067 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1063 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1063 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  44.64 
 
 		 1121 aa  833    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  44.47 
 
 		 1038 aa  822    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  40.93 
 
 		 1052 aa  761    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  37.38 
 
 		 1053 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  37.58 
 
 		 1048 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1063 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 		 1063 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  37.81 
 
 		 1039 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  61.71 
 
 		 1042 aa  1307    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1034 aa  2065    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  36.8 
 
 		 1049 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1055 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 		 1067 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  37.46 
 
 		 1067 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 		 1063 aa  717    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 		 1050 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  46.01 
 
 		 1032 aa  889    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  38.29 
 
 		 1044 aa  671    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  38.2 
 
 		 1051 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  37.56 
 
 		 1067 aa  711    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.11 
 
 		 1067 aa  702    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1060 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1073 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1060 aa  611  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1057 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.2 
 
 		 1054 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1061 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  36.49 
 
 		 1075 aa  590  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1069 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.75 
 
 		 1074 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1060 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.71 
 
 		 1093 aa  561  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  34.44 
 
 		 1056 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  33.72 
 
 		 1050 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1052 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  35.53 
 
 		 1041 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1033 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1033 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1053 aa  523  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1074 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1098 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1043 aa  523  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1053 aa  522  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1050 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1072 aa  514  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1040 aa  512  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1068 aa  512  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1054 aa  502  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1036 aa  502  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1066 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1033 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1030 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1053 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1035 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.85 
 
 		 1071 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1064 aa  483  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1062 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1041 aa  483  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.89 
 
 		 1034 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.87 
 
 		 1048 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1054 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1035 aa  469  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1063 aa  459  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1048 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  29 
 
 		 1053 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1035 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1030 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1131 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.92 
 
 		 1135 aa  356  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1043 aa  349  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1050 aa  349  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1191 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1044 aa  340  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  28.07 
 
 		 1042 aa  339  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1137 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1143 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.11 
 
 		 1095 aa  313  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1034 aa  313  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1055 aa  312  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.15 
 
 		 1005 aa  312  2.9999999999999997e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1044 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1038 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.21 
 
 		 1052 aa  308  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1046 aa  308  4.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1043 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1034 aa  303  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.18 
 
 		 1036 aa  303  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.23 
 
 		 1056 aa  303  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1070 aa  300  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1075 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1146 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1025 aa  298  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1028 aa  297  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1064 aa  297  9e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>