More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1563 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  61.87 
 
 		 1033 aa  1314    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  59.46 
 
 		 1036 aa  1242    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  60.6 
 
 		 1034 aa  1279    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1041 aa  2113    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  54.95 
 
 		 1063 aa  1177    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  40.49 
 
 		 1030 aa  779    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 		 1035 aa  753    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1033 aa  903    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  59.19 
 
 		 1035 aa  1264    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  56.4 
 
 		 1041 aa  1216    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  31.73 
 
 		 1052 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1048 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1067 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1067 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1067 aa  572  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1063 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1063 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1063 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.01 
 
 		 1067 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  32.27 
 
 		 1044 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1063 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1063 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1055 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1053 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1049 aa  547  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1054 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1050 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.07 
 
 		 1067 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1032 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.43 
 
 		 1041 aa  519  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1121 aa  519  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  31.46 
 
 		 1039 aa  515  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1043 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1033 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  29.53 
 
 		 1050 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1051 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1038 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1052 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1069 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.6 
 
 		 1056 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1040 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1053 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  29.74 
 
 		 1042 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.04 
 
 		 1075 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  29.04 
 
 		 1071 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1053 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1054 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1074 aa  476  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1053 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1050 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.98 
 
 		 1093 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.56 
 
 		 1054 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1060 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1060 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1068 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1064 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1073 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1057 aa  446  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.9 
 
 		 1074 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1061 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1048 aa  432  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  28.99 
 
 		 1048 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1041 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1060 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.95 
 
 		 1060 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1062 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1098 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1131 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  29.41 
 
 		 1135 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1066 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  26.43 
 
 		 1053 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1072 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1035 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1030 aa  360  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1137 aa  353  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1011 aa  329  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.92 
 
 		 1036 aa  325  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1038 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1043 aa  322  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1044 aa  320  7.999999999999999e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1044 aa  319  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1057 aa  317  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1056 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1034 aa  310  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1063 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1034 aa  306  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1041 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.27 
 
 		 1050 aa  305  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1028 aa  304  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1028 aa  304  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1059 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1067 aa  303  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1028 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 		 1070 aa  300  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.12 
 
 		 1005 aa  297  6e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1039 aa  296  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1051 aa  294  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1014 aa  293  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1046 aa  292  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>