More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06545 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  43.01 
 
 
1044 aa  827    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  42.59 
 
 
1049 aa  826    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  100 
 
 
1052 aa  2140    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.87 
 
 
1074 aa  958    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.06 
 
 
1067 aa  841    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  92.2 
 
 
1050 aa  1952    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  47.64 
 
 
1057 aa  967    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  43.48 
 
 
1063 aa  846    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  46.49 
 
 
1073 aa  959    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  43.83 
 
 
1063 aa  864    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  43.74 
 
 
1063 aa  863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  43.04 
 
 
1048 aa  841    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  37.34 
 
 
1039 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.77 
 
 
1093 aa  886    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  43.83 
 
 
1063 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  45.59 
 
 
1060 aa  944    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  41.87 
 
 
1055 aa  817    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  68.07 
 
 
1069 aa  1461    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  47.11 
 
 
1060 aa  969    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  42.86 
 
 
1067 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 
1067 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  42.04 
 
 
1050 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  67.37 
 
 
1056 aa  1441    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  46.16 
 
 
1061 aa  924    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 
1053 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  42.67 
 
 
1067 aa  853    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.89 
 
 
1067 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  43.74 
 
 
1063 aa  863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  46.9 
 
 
1060 aa  927    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.81 
 
 
1041 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1121 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.68 
 
 
1052 aa  598  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 
1072 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 
1038 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 
1068 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 
1053 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 
1032 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1051 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  32.59 
 
 
1042 aa  546  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 
1062 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 
1066 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1034 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.15 
 
 
1060 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 
1041 aa  499  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.7 
 
 
1071 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 
1053 aa  480  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 
1054 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 
1054 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.64 
 
 
1054 aa  472  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.69 
 
 
1048 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.46 
 
 
1053 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 
1041 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.53 
 
 
1075 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 
1041 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 
1035 aa  466  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 
1098 aa  465  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1033 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 
1040 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 
1036 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 
1050 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 
1043 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.99 
 
 
1033 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 
1063 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.18 
 
 
1034 aa  452  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
1048 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 
1033 aa  439  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 
1074 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  29 
 
 
1053 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 
1030 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 
1064 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 
1035 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.84 
 
 
1135 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 
1131 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 
1030 aa  333  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 
1035 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  24.67 
 
 
1064 aa  304  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 
1044 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 
1092 aa  292  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 
1043 aa  290  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  23.61 
 
 
1044 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 
1034 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.72 
 
 
1070 aa  287  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  22.8 
 
 
1057 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 
1043 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.24 
 
 
1005 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 
1038 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 
1059 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 
1011 aa  282  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 
1034 aa  282  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  23.3 
 
 
1039 aa  281  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 
1191 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 
1058 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  23.66 
 
 
1095 aa  277  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  23.57 
 
 
1006 aa  274  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  23.91 
 
 
1050 aa  273  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 
1030 aa  271  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.77 
 
 
1046 aa  271  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 
1031 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 
1017 aa  270  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  23.3 
 
 
1056 aa  270  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>