More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01000 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  38.39 
 
 		 1034 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  45.14 
 
 		 1057 aa  961    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  56.1 
 
 		 1063 aa  1216    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  55.16 
 
 		 1055 aa  1179    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.56 
 
 		 1074 aa  1015    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.57 
 
 		 1041 aa  808    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  56.85 
 
 		 1048 aa  1222    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  54.81 
 
 		 1067 aa  1205    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  56.1 
 
 		 1063 aa  1216    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  46.05 
 
 		 1060 aa  928    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  100 
 
 		 1044 aa  2109    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  41.07 
 
 		 1052 aa  822    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 		 1062 aa  661    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  42.39 
 
 		 1050 aa  835    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  41.76 
 
 		 1039 aa  813    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.19 
 
 		 1093 aa  885    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.43 
 
 		 1042 aa  652    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  45.17 
 
 		 1060 aa  954    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  39.34 
 
 		 1038 aa  704    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  46.54 
 
 		 1060 aa  964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  55.54 
 
 		 1049 aa  1170    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  44.14 
 
 		 1073 aa  938    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  43.88 
 
 		 1069 aa  852    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  38.39 
 
 		 1068 aa  690    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  56.2 
 
 		 1063 aa  1217    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  56.67 
 
 		 1063 aa  1222    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  56.56 
 
 		 1067 aa  1221    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  56.67 
 
 		 1067 aa  1223    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  55.24 
 
 		 1050 aa  1180    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  40.97 
 
 		 1121 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  45.48 
 
 		 1061 aa  929    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  43.01 
 
 		 1052 aa  835    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  38.59 
 
 		 1053 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  36.03 
 
 		 1072 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  36.71 
 
 		 1051 aa  677    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1032 aa  726    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  56.38 
 
 		 1067 aa  1218    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  56 
 
 		 1063 aa  1215    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  43.66 
 
 		 1056 aa  840    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  54.9 
 
 		 1053 aa  1168    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  55.18 
 
 		 1067 aa  1165    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 		 1066 aa  635  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  36.22 
 
 		 1075 aa  622  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.72 
 
 		 1054 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1033 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1041 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1041 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1050 aa  571  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1053 aa  572  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  34.57 
 
 		 1071 aa  565  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1041 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  34.41 
 
 		 1048 aa  554  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1033 aa  555  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  33.23 
 
 		 1035 aa  552  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1098 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.34 
 
 		 1034 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1033 aa  549  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1040 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  31.41 
 
 		 1053 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1036 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.62 
 
 		 1074 aa  549  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1054 aa  545  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1063 aa  546  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1054 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1048 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1043 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.92 
 
 		 1060 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1053 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1030 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1064 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1035 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1131 aa  426  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1035 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.53 
 
 		 1135 aa  386  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1030 aa  372  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1056 aa  364  6e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1064 aa  357  5e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1137 aa  353  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1038 aa  349  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1092 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1044 aa  337  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1070 aa  332  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1057 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1050 aa  326  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.29 
 
 		 1044 aa  324  7e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1063 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1034 aa  322  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1022 aa  321  5e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.97 
 
 		 1058 aa  321  5e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1041 aa  320  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1191 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1059 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1043 aa  319  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1069 aa  318  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1034 aa  317  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1043 aa  317  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  25.47 
 
 		 1134 aa  317  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1058 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.76 
 
 		 1036 aa  314  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1044 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>