More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2050 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  39.01 
 
 		 1024 aa  777    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  46.88 
 
 		 1038 aa  946    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.84 
 
 		 1052 aa  1024    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  48.41 
 
 		 1034 aa  972    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  48.96 
 
 		 1048 aa  993    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  36.71 
 
 		 1038 aa  734    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 		 1189 aa  678    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  48.69 
 
 		 1042 aa  991    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 		 1041 aa  990    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.93 
 
 		 1025 aa  645    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.22 
 
 		 1032 aa  734    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  47.24 
 
 		 1068 aa  948    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  46.04 
 
 		 1045 aa  963    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1069 aa  2154    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  42.88 
 
 		 1057 aa  887    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  48.01 
 
 		 1044 aa  957    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  42.8 
 
 		 1067 aa  805    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  47.72 
 
 		 1033 aa  919    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  48.31 
 
 		 1039 aa  971    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1092 aa  586  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1043 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1191 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  30.5 
 
 		 1134 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1267 aa  443  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1124 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1146 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 		 1335 aa  429  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  28.57 
 
 		 1165 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1038 aa  351  5e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1040 aa  345  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1290 aa  343  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1050 aa  342  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1044 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.08 
 
 		 1067 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1033 aa  335  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1063 aa  333  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1014 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1063 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1046 aa  328  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1063 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1063 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1020 aa  327  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1063 aa  327  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1043 aa  326  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1006 aa  325  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1071 aa  324  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1067 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1022 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1038 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1067 aa  322  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1067 aa  321  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1055 aa  320  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1049 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1038 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1121 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26 
 
 		 1044 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1053 aa  312  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  24.43 
 
 		 1028 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1034 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  26.61 
 
 		 1039 aa  308  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.31 
 
 		 1024 aa  307  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1011 aa  306  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1044 aa  306  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.26 
 
 		 1067 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1031 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1048 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 1050 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1030 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.96 
 
 		 1041 aa  304  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1047 aa  304  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.34 
 
 		 1034 aa  303  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1055 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.87 
 
 		 1024 aa  302  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1048 aa  302  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.74 
 
 		 1068 aa  303  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 		 1143 aa  300  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1039 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1034 aa  300  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.31 
 
 		 1034 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 1031 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  298  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1031 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 1031 aa  298  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1050 aa  297  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1031 aa  297  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1048 aa  294  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.68 
 
 		 1031 aa  294  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1074 aa  294  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1043 aa  294  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  25.05 
 
 		 1035 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 		 1050 aa  293  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  26.65 
 
 		 1044 aa  293  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  24.44 
 
 		 1028 aa  293  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1047 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.72 
 
 		 1028 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1023 aa  292  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  24.84 
 
 		 1020 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  24.03 
 
 		 1022 aa  291  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>