More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1679 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  42 
 
 		 1024 aa  849    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  50.34 
 
 		 1034 aa  979    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.55 
 
 		 1052 aa  1088    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1048 aa  2089    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  49.42 
 
 		 1069 aa  1030    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  38.54 
 
 		 1038 aa  796    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  47.2 
 
 		 1068 aa  956    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.74 
 
 		 1025 aa  704    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.11 
 
 		 1032 aa  790    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  54.76 
 
 		 1041 aa  1075    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  50.05 
 
 		 1044 aa  982    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  51.01 
 
 		 1045 aa  1023    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  46.06 
 
 		 1057 aa  897    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  50.97 
 
 		 1039 aa  989    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1067 aa  787    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  56.44 
 
 		 1033 aa  1044    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  52.22 
 
 		 1038 aa  1021    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  50.34 
 
 		 1042 aa  997    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1092 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  37.55 
 
 		 1043 aa  602  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1267 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1335 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1191 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1124 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  28.87 
 
 		 1165 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  44.44 
 
 		 1189 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  28.26 
 
 		 1134 aa  438  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1011 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1050 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1039 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1028 aa  363  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1040 aa  359  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1044 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1038 aa  353  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1038 aa  349  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1033 aa  348  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1034 aa  348  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1032 aa  346  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1046 aa  346  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1034 aa  346  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1470 aa  344  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1020 aa  344  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1028 aa  341  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1044 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1028 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1006 aa  336  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1041 aa  335  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1033 aa  334  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  27.1 
 
 		 1039 aa  334  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1014 aa  333  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1031 aa  333  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1030 aa  331  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1041 aa  330  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1020 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1048 aa  328  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.69 
 
 		 1024 aa  327  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1043 aa  326  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1017 aa  326  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1031 aa  326  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1031 aa  326  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1031 aa  326  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1036 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 1496 aa  324  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1031 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1071 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.51 
 
 		 1031 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1031 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1050 aa  323  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1044 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.78 
 
 		 1024 aa  323  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1031 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1031 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.39 
 
 		 1036 aa  322  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.75 
 
 		 1034 aa  322  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1019 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1290 aa  320  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1050 aa  320  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.99 
 
 		 1041 aa  319  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1029 aa  318  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1034 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1043 aa  314  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1042 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1031 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1028 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1062 aa  310  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1026 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1035 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1121 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.43 
 
 		 1049 aa  308  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1101 aa  307  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1035 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1563  cation/multidrug efflux pump-like  28.61 
 
 		 1055 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.974109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1039 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1046 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1045 aa  304  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1030 aa  304  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1036 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.76 
 
 		 1067 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>