More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0619 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  38.73 
 
 		 1024 aa  774    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  65.28 
 
 		 1052 aa  1414    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  59.83 
 
 		 1034 aa  1206    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  59.84 
 
 		 1038 aa  1219    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  58.56 
 
 		 1039 aa  1171    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  58.5 
 
 		 1042 aa  1227    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  37.71 
 
 		 1038 aa  768    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.99 
 
 		 1025 aa  659    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.67 
 
 		 1032 aa  764    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  46.73 
 
 		 1068 aa  975    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  50.89 
 
 		 1048 aa  1008    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1045 aa  2112    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  43.27 
 
 		 1057 aa  853    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  58.86 
 
 		 1044 aa  1190    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1041 aa  997    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  42.86 
 
 		 1067 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  47.63 
 
 		 1033 aa  908    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  46.04 
 
 		 1069 aa  978    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 		 1092 aa  597  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1043 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1335 aa  522  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  29.96 
 
 		 1134 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1143 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  44.65 
 
 		 1189 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  30.19 
 
 		 1165 aa  436  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  44.04 
 
 		 1267 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1014 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  39.51 
 
 		 1290 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1032 aa  332  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1050 aa  329  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1039 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1034 aa  322  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1026 aa  321  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1011 aa  318  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1044 aa  317  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1055 aa  316  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 1496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1028 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 		 1038 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1046 aa  312  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1038 aa  312  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1043 aa  313  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1470 aa  310  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1040 aa  308  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1034 aa  308  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1028 aa  307  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1041 aa  307  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1044 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1034 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1041 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 		 1028 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1022 aa  304  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1045 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1036 aa  302  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1026 aa  301  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1020 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.8 
 
 		 1024 aa  299  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1038 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  25.99 
 
 		 1052 aa  298  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1030 aa  297  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1044 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1038 aa  293  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.5 
 
 		 1031 aa  293  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1022 aa  292  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1033 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1033 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1064 aa  290  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.28 
 
 		 1027 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  23.83 
 
 		 1006 aa  290  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1047 aa  290  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1074 aa  290  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1044 aa  288  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.71 
 
 		 1036 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1058 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1050 aa  288  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.3 
 
 		 1049 aa  288  5e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1034 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 		 1043 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 		 1105 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1028 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1067 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1049 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1040 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1020 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1029 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.38 
 
 		 1069 aa  283  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1022 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1028 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1031 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1031 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1191 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1028 aa  281  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1031 aa  281  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1031 aa  281  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1024 aa  281  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1048 aa  281  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1029 aa  281  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  281  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>