More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3431 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1143 aa  2303    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  36.2 
 
 		 1043 aa  647    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  38.32 
 
 		 1165 aa  781    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  52.1 
 
 		 1124 aa  1134    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  50.48 
 
 		 1134 aa  1150    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  52.7 
 
 		 1191 aa  1192    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  77.45 
 
 		 1146 aa  1795    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  33.9 
 
 		 1092 aa  621  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1050 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1068 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1041 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1045 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.76 
 
 		 1052 aa  433  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  29.56 
 
 		 1042 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1011 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1189 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  29.96 
 
 		 1039 aa  426  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1034 aa  426  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  29.93 
 
 		 1024 aa  419  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1038 aa  419  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.57 
 
 		 1032 aa  418  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1044 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1038 aa  410  1e-113  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1043 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1038 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1041 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  38.69 
 
 		 1290 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1044 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1063 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1053 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1071 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1267 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 		 1496 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1032 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1470 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1020 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1039 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1058 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.09 
 
 		 1049 aa  379  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1055 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1028 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1043 aa  376  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.1 
 
 		 1050 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1033 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1040 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.09 
 
 		 1024 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1121 aa  366  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1028 aa  366  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1058 aa  366  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1036 aa  365  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1028 aa  362  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1059 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1034 aa  361  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1014 aa  360  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1034 aa  358  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.41 
 
 		 1069 aa  357  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1048 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1006 aa  355  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1038 aa  353  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1070 aa  353  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1029 aa  349  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1040 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1065 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1040 aa  346  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  25.53 
 
 		 1025 aa  345  2.9999999999999997e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1033 aa  345  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1038 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1095 aa  344  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1042 aa  344  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.3 
 
 		 1041 aa  343  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1054 aa  343  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1095 aa  342  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1054 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1045 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1173 aa  341  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  27.62 
 
 		 1039 aa  340  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1041 aa  339  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1063 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1063 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1063 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1035 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1054 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1063 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1060 aa  337  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1048 aa  337  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.63 
 
 		 1067 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1105 aa  336  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1063 aa  336  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1037 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1067 aa  334  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1044 aa  334  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  25.5 
 
 		 1067 aa  333  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.5 
 
 		 1067 aa  333  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1027 aa  333  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1067 aa  332  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1075 aa  331  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.69 
 
 		 1052 aa  330  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1060 aa  330  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1033 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1067 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>