More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5504 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  51.71 
 
 		 1191 aa  1166    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  38.93 
 
 		 1165 aa  797    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1146 aa  2301    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  50.44 
 
 		 1134 aa  1150    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  51.34 
 
 		 1124 aa  1124    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  77.45 
 
 		 1143 aa  1816    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1043 aa  635  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.08 
 
 		 1092 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.58 
 
 		 1052 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1050 aa  469  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1068 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1041 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1044 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1069 aa  446  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  29.47 
 
 		 1042 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  31.61 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1189 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  28.15 
 
 		 1024 aa  423  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1044 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1038 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  28.55 
 
 		 1039 aa  410  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1071 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1038 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1044 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  39.03 
 
 		 1290 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1034 aa  406  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1041 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1011 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 1496 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1267 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1033 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1039 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1028 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1043 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1058 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1032 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1020 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1028 aa  380  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1059 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1053 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1067 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.32 
 
 		 1049 aa  373  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1034 aa  373  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1046 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.89 
 
 		 1069 aa  367  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1058 aa  366  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1070 aa  363  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1054 aa  363  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1054 aa  363  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1063 aa  360  8e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1054 aa  360  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1065 aa  357  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.45 
 
 		 1050 aa  355  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1040 aa  355  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1030 aa  354  5.9999999999999994e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1075 aa  353  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1038 aa  353  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1014 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1028 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1041 aa  352  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1055 aa  352  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1036 aa  352  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1121 aa  352  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1044 aa  351  6e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1033 aa  350  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.27 
 
 		 1036 aa  347  6e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1101 aa  347  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.93 
 
 		 1041 aa  346  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.34 
 
 		 1024 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1095 aa  345  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.62 
 
 		 1052 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1028 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1023 aa  345  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1049 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  27.36 
 
 		 1039 aa  342  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1034 aa  341  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  24.78 
 
 		 1040 aa  340  7e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1042 aa  340  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1048 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1049 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1067 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1110 aa  337  5.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1026 aa  337  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1063 aa  337  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1063 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1063 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1063 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1156 aa  336  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1033 aa  335  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1063 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1028 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1046 aa  334  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1067 aa  334  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1067 aa  333  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1067 aa  333  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1029 aa  331  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>