More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3332 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  39.32 
 
 		 1024 aa  774    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.83 
 
 		 1052 aa  878    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  42.88 
 
 		 1069 aa  887    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1038 aa  692    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  43.54 
 
 		 1034 aa  829    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.55 
 
 		 1032 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  43.34 
 
 		 1044 aa  826    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  43.27 
 
 		 1045 aa  839    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  42.64 
 
 		 1039 aa  816    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1057 aa  2120    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  44.05 
 
 		 1068 aa  910    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 		 1041 aa  847    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  39.88 
 
 		 1067 aa  725    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  44.91 
 
 		 1033 aa  816    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  45.87 
 
 		 1048 aa  870    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  42.93 
 
 		 1038 aa  827    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  42.7 
 
 		 1042 aa  848    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.4 
 
 		 1025 aa  603  1.0000000000000001e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 		 1092 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  35.53 
 
 		 1043 aa  597  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1191 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  29.26 
 
 		 1134 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  29.83 
 
 		 1165 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1189 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 		 1335 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  41.72 
 
 		 1267 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1034 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1050 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1044 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1020 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1101 aa  359  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1014 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1026 aa  357  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1470 aa  350  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1039 aa  350  8e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1020 aa  350  9e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1043 aa  348  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1032 aa  346  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1011 aa  346  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1028 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.15 
 
 		 1036 aa  341  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1028 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1023 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1028 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1034 aa  337  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1034 aa  336  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 1496 aa  336  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0307  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1056 aa  335  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641909  normal  0.615822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1044 aa  333  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1041 aa  331  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1034 aa  330  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1071 aa  330  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.25 
 
 		 1034 aa  330  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1033 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1036 aa  328  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1041 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1046 aa  327  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1290 aa  327  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1040 aa  325  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1026 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.33 
 
 		 1031 aa  323  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1036 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1030 aa  320  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1055 aa  320  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1050 aa  319  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1043 aa  319  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1031 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1054 aa  319  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 		 1029 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1030 aa  318  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1054 aa  318  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1051 aa  317  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1031 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1031 aa  317  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1031 aa  317  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1031 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1027 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1054 aa  316  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.14 
 
 		 1050 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1031 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1031 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1045 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1014 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1028 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1031 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1038 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1031 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1022 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1121 aa  312  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 		 1055 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.03 
 
 		 1068 aa  312  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1026 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1048 aa  313  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  24.74 
 
 		 1069 aa  312  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1031 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.11 
 
 		 1070 aa  311  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1063 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1042 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1017 aa  310  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>