More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2936 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1053 aa  2090    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  53.04 
 
 		 1054 aa  1058    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  55.92 
 
 		 1064 aa  1095    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  61.52 
 
 		 1043 aa  1233    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  53.06 
 
 		 1040 aa  1038    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  56.05 
 
 		 1074 aa  1122    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  53.05 
 
 		 1050 aa  1070    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.61 
 
 		 1052 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1131 aa  575  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.45 
 
 		 1041 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1121 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1067 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.27 
 
 		 1067 aa  545  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1067 aa  546  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1063 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 		 1067 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1063 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1063 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1063 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  31.98 
 
 		 1044 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1048 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1063 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1032 aa  536  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.99 
 
 		 1039 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 		 1033 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.89 
 
 		 1067 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1055 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  34.25 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  31.47 
 
 		 1042 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1137 aa  512  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  35.54 
 
 		 1135 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 		 1051 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1050 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1053 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 		 1049 aa  502  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1069 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1033 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1060 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1073 aa  486  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1068 aa  486  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.77 
 
 		 1034 aa  485  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1057 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1034 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1060 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1030 aa  479  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1035 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1035 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1041 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1061 aa  475  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1062 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.26 
 
 		 1054 aa  469  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1036 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.42 
 
 		 1056 aa  469  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1053 aa  465  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.99 
 
 		 1074 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  28.99 
 
 		 1050 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1033 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1063 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1054 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1060 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.82 
 
 		 1093 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1041 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1053 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1052 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.72 
 
 		 1075 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1066 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.77 
 
 		 1048 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1048 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  28.6 
 
 		 1071 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.53 
 
 		 1053 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1072 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.67 
 
 		 1060 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1035 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1098 aa  358  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1030 aa  336  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.35 
 
 		 1005 aa  332  3e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1044 aa  329  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1092 aa  327  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1043 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.2 
 
 		 1044 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1022 aa  320  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1056 aa  315  3.9999999999999997e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1050 aa  307  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1028 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1025 aa  304  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1044 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1011 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1025 aa  301  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1046 aa  300  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1055 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1059 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1051 aa  297  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1040 aa  297  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1038 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.04 
 
 		 1191 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1028 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1039 aa  293  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.98 
 
 		 1022 aa  290  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  23.72 
 
 		 1039 aa  289  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>