More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1637 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  43.98 
 
 		 1071 aa  862    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1048 aa  2101    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  65.39 
 
 		 1053 aa  1406    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  72.34 
 
 		 1048 aa  1524    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  66.22 
 
 		 1054 aa  1414    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.14 
 
 		 1067 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1063 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  32.92 
 
 		 1052 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1067 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1067 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1067 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1032 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1055 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1048 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1063 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1063 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1063 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1063 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1053 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1049 aa  559  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.15 
 
 		 1041 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1121 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.27 
 
 		 1067 aa  554  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  34.06 
 
 		 1039 aa  552  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1050 aa  548  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  32.98 
 
 		 1044 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 		 1060 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1060 aa  528  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1073 aa  526  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1068 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1061 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1035 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  31.52 
 
 		 1034 aa  512  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.69 
 
 		 1074 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1057 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1033 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1060 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1033 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  31.17 
 
 		 1050 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1036 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1053 aa  492  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1038 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1063 aa  486  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.97 
 
 		 1093 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1051 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1062 aa  483  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1052 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1066 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1074 aa  475  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1030 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.18 
 
 		 1056 aa  473  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1069 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1072 aa  467  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1041 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1034 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1050 aa  456  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  30.84 
 
 		 1075 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1041 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.54 
 
 		 1053 aa  439  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  27.8 
 
 		 1042 aa  439  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1054 aa  432  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1043 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1035 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.48 
 
 		 1054 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1033 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1040 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1064 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1053 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1098 aa  403  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.02 
 
 		 1060 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1035 aa  383  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1030 aa  372  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1011 aa  360  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1131 aa  357  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1028 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1034 aa  331  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1137 aa  328  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1050 aa  328  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1028 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.65 
 
 		 1024 aa  327  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1046 aa  323  7e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1041 aa  321  6e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.09 
 
 		 1135 aa  320  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1063 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1043 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1043 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  27.23 
 
 		 1134 aa  313  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1025 aa  312  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1044 aa  311  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1034 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1039 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1044 aa  307  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1092 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1028 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1055 aa  304  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25 
 
 		 1036 aa  302  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1191 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1046 aa  300  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>