More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3188 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1030 aa  820    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  46.06 
 
 		 1033 aa  911    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  43.74 
 
 		 1063 aa  874    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  44.67 
 
 		 1036 aa  875    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  44.54 
 
 		 1034 aa  872    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1041 aa  917    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  44.81 
 
 		 1035 aa  905    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  44.48 
 
 		 1035 aa  853    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1033 aa  2065    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  43.86 
 
 		 1041 aa  890    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.46 
 
 		 1052 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1063 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1048 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1067 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.02 
 
 		 1067 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1063 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1063 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1067 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  33.62 
 
 		 1044 aa  579  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1063 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1049 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1063 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1067 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1074 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1055 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1053 aa  562  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1050 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.3 
 
 		 1067 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.78 
 
 		 1041 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1121 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.01 
 
 		 1039 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1054 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1032 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1038 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1051 aa  527  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1040 aa  524  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1043 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1054 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1033 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.38 
 
 		 1071 aa  507  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 		 1053 aa  509  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1034 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1060 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1073 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  33.01 
 
 		 1075 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.91 
 
 		 1048 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.44 
 
 		 1093 aa  497  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  30.31 
 
 		 1042 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1041 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  30.62 
 
 		 1060 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.57 
 
 		 1056 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  29.83 
 
 		 1050 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1048 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1057 aa  482  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1069 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1050 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1060 aa  479  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1053 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1061 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1052 aa  465  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1064 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.64 
 
 		 1074 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.54 
 
 		 1054 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1072 aa  439  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1098 aa  435  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1068 aa  435  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1066 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.06 
 
 		 1060 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1062 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1131 aa  396  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  27.33 
 
 		 1053 aa  382  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1044 aa  363  8e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1035 aa  362  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1137 aa  360  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  29.62 
 
 		 1135 aa  355  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1044 aa  351  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1022 aa  348  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1030 aa  348  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1095 aa  338  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.03 
 
 		 1005 aa  336  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1034 aa  331  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1055 aa  331  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1044 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1038 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1011 aa  323  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1043 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1034 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1028 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1070 aa  315  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1028 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1063 aa  314  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1025 aa  313  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1075 aa  312  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1047 aa  312  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1050 aa  310  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.23 
 
 		 1069 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1030 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1191 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.49 
 
 		 1024 aa  308  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>