More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3081 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  100 
 
 		 1135 aa  2244    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  64 
 
 		 1131 aa  1378    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  64.71 
 
 		 1137 aa  1313    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1043 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 		 1050 aa  556  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1053 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1074 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1054 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1040 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1064 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1062 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1041 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1053 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1063 aa  439  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  30.97 
 
 		 1042 aa  436  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1063 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1063 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1063 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1063 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1067 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  28.37 
 
 		 1044 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1032 aa  422  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1067 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.44 
 
 		 1041 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.63 
 
 		 1067 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1121 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  30.44 
 
 		 1052 aa  416  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1048 aa  416  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1052 aa  416  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1067 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1068 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1055 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1050 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1051 aa  413  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1033 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  28.54 
 
 		 1050 aa  413  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1041 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1036 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  30.53 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1053 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.74 
 
 		 1034 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1033 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.87 
 
 		 1093 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1030 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1038 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.68 
 
 		 1075 aa  399  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1057 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.08 
 
 		 1067 aa  399  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1049 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1035 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1072 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1063 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1053 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1060 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1069 aa  383  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1033 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.6 
 
 		 1054 aa  376  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1060 aa  376  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1073 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1054 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1061 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1066 aa  363  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  28.2 
 
 		 1048 aa  357  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1048 aa  357  7.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.42 
 
 		 1074 aa  345  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.01 
 
 		 1056 aa  343  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1060 aa  343  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1035 aa  337  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.07 
 
 		 1060 aa  333  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  27.53 
 
 		 1071 aa  330  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1041 aa  328  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  25.61 
 
 		 1053 aa  317  8e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1098 aa  304  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1044 aa  289  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1011 aa  283  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1035 aa  275  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1044 aa  273  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1050 aa  270  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1043 aa  270  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1064 aa  268  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  24.53 
 
 		 1056 aa  266  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.05 
 
 		 1005 aa  264  8e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1069 aa  262  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.82 
 
 		 1046 aa  258  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1057 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1092 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1045 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  22.57 
 
 		 1038 aa  248  4.9999999999999997e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1055 aa  247  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  23.96 
 
 		 1040 aa  246  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  26.74 
 
 		 1042 aa  244  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1027 aa  243  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.13 
 
 		 1052 aa  242  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.12 
 
 		 1049 aa  239  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  24.81 
 
 		 1041 aa  237  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  23.36 
 
 		 1057 aa  234  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.24 
 
 		 1036 aa  234  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1028 aa  234  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1044 aa  233  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>