More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3898 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1131 aa  2232    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  66.95 
 
 		 1137 aa  1323    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  64.13 
 
 		 1135 aa  1342    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1053 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  35.54 
 
 		 1074 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  36.31 
 
 		 1043 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1050 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1054 aa  548  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1040 aa  545  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1064 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1053 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  30.43 
 
 		 1052 aa  436  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  29.83 
 
 		 1044 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1041 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1048 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1053 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 1032 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.57 
 
 		 1067 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1033 aa  420  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1063 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1063 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1063 aa  416  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1055 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1063 aa  413  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1062 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1063 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1051 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  29.9 
 
 		 1042 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1067 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1050 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1067 aa  406  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1067 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.11 
 
 		 1041 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.11 
 
 		 1067 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  27.84 
 
 		 1050 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1121 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1049 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1035 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1041 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1038 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.52 
 
 		 1034 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  29.31 
 
 		 1039 aa  393  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1060 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1033 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1036 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1052 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1063 aa  386  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1057 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  30.08 
 
 		 1075 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1068 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1033 aa  373  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1060 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1073 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.32 
 
 		 1054 aa  369  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1069 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  28.95 
 
 		 1071 aa  366  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1048 aa  365  4e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1053 aa  363  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.13 
 
 		 1093 aa  363  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1054 aa  363  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1072 aa  360  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1030 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1060 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1061 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1066 aa  350  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1034 aa  349  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  26.57 
 
 		 1048 aa  348  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.85 
 
 		 1056 aa  346  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.91 
 
 		 1074 aa  342  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.29 
 
 		 1060 aa  340  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1041 aa  320  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1035 aa  311  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  24.63 
 
 		 1053 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1035 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.93 
 
 		 1049 aa  273  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1044 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  26 
 
 		 1098 aa  266  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1050 aa  266  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  23.03 
 
 		 1039 aa  262  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  23.06 
 
 		 1056 aa  260  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1031 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1064 aa  256  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1044 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1028 aa  252  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1048 aa  250  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1069 aa  248  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  23.94 
 
 		 1035 aa  248  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.29 
 
 		 1011 aa  247  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 1043 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1044 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  23.63 
 
 		 1023 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1034 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.62 
 
 		 1046 aa  241  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1055 aa  241  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.2 
 
 		 1030 aa  240  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  23.46 
 
 		 1005 aa  239  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1036 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1043 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  24.23 
 
 		 1134 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  24.57 
 
 		 1046 aa  233  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>