More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1993 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1025 aa  2056    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  50.64 
 
 		 1025 aa  1001    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1033 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1035 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1030 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.05 
 
 		 1011 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1043 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1563  cation/multidrug efflux pump-like  30.43 
 
 		 1055 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.974109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1121 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1040 aa  355  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 		 1050 aa  355  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1092 aa  354  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1041 aa  352  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1063 aa  350  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1053 aa  350  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1055 aa  347  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1035 aa  344  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1064 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.33 
 
 		 1067 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1043 aa  335  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1044 aa  334  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1030 aa  333  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1063 aa  333  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1036 aa  333  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.12 
 
 		 1052 aa  332  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1032 aa  330  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1050 aa  330  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1067 aa  330  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1067 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1067 aa  327  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.43 
 
 		 1034 aa  325  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1035 aa  323  7e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1038 aa  323  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1053 aa  323  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1033 aa  323  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1063 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1063 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1063 aa  322  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1063 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1191 aa  320  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.14 
 
 		 1049 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  25.27 
 
 		 1048 aa  318  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1040 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1034 aa  318  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1050 aa  318  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1036 aa  317  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.6 
 
 		 1024 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  27.59 
 
 		 1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1054 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 1496 aa  313  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1032 aa  313  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1053 aa  313  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.67 
 
 		 1036 aa  311  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1041 aa  310  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1046 aa  310  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1057 aa  310  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1068 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1069 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.51 
 
 		 1069 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.27 
 
 		 1067 aa  307  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1041 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1034 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1033 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1043 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1060 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1054 aa  304  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1045 aa  304  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1146 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  27.79 
 
 		 1042 aa  304  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1038 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1055 aa  302  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1470 aa  303  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1057 aa  303  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1023 aa  301  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1044 aa  301  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.34 
 
 		 1074 aa  300  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1038 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1143 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1048 aa  299  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1041 aa  298  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  25.17 
 
 		 1044 aa  298  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1009 aa  297  7e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1073 aa  296  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.93 
 
 		 1041 aa  296  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1058 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  23.54 
 
 		 1056 aa  296  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1044 aa  296  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.58 
 
 		 1050 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1043 aa  295  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1033 aa  295  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1069 aa  294  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1049 aa  294  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 1044 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1039 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  23.87 
 
 		 1058 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1070 aa  292  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1034 aa  292  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1057 aa  292  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1039 aa  293  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1060 aa  291  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>