More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2902 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2902  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1236 aa  2451    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1047 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  33.26 
 
 		 1053 aa  429  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1051 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1048 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1035 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1036 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1050 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1067 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1047 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1036 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1046 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.41 
 
 		 1039 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1041 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1046 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1044 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1049 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  30.67 
 
 		 1046 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  32.46 
 
 		 1041 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1033 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1049 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1071 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1046 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1089 aa  409  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1073 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1019 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1039 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.28 
 
 		 1033 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  31.66 
 
 		 1022 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1045 aa  406  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2575  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1071 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1039 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1060 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1019 aa  399  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1021 aa  396  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  31.44 
 
 		 1025 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1040 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1041 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1020 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1021 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1017 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1023 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0734  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1035 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1020 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1017 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.16 
 
 		 1024 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1056 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1054 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.13 
 
 		 1019 aa  383  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3302  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.4 
 
 		 1011 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1012 aa  383  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  30.62 
 
 		 1031 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1031 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.16 
 
 		 1024 aa  382  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1016 aa  380  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1044 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1018 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1024 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3538  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1057 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1047 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2655  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1031 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0816  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1035 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  31.04 
 
 		 1025 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1967  RND family multidrug efflux protein  30.94 
 
 		 1045 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585173  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1020 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.84 
 
 		 1036 aa  370  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1018 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1051 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1425  RND family mulitdrug efflux protein  30.56 
 
 		 1110 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.400859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  29.86 
 
 		 1015 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  30.82 
 
 		 1025 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1017 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1057 aa  366  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.651759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  29.78 
 
 		 1015 aa  366  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2104  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.48 
 
 		 1056 aa  365  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1042 aa  365  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1048 aa  365  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2296  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.37 
 
 		 1056 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2163  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.37 
 
 		 1056 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2689  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1026 aa  363  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0953  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.37 
 
 		 1056 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1014 aa  362  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  30.9 
 
 		 1025 aa  362  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1020 aa  362  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0941  cation efflux system protein  28.87 
 
 		 1020 aa  362  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1020 aa  361  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.16 
 
 		 1010 aa  360  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1059 aa  360  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.84 
 
 		 1017 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1048 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1029 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6339  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1049 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1519  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1050 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.352898  normal  0.340247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1049 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1047 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1047 aa  357  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1053 aa  357  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1021 aa  357  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4856  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1023 aa  355  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287166  normal  0.936092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>