More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1324 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2636  acriflavin resistance protein  74.29 
 
 		 1025 aa  1523    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.545015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3279  AcrB/AcrD/AcrF family protein  72.66 
 
 		 1026 aa  1500    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00488  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.43 
 
 		 1048 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1324  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1038 aa  2081    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.778616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2988  acriflavin resistance protein  75.25 
 
 		 1022 aa  1548    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 		 1029 aa  763    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3132  acriflavin resistance protein  75.25 
 
 		 1022 aa  1544    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  76.01 
 
 		 1023 aa  1592    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  80.75 
 
 		 1026 aa  1615    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  40.9 
 
 		 1039 aa  756    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  80.75 
 
 		 1030 aa  1636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  75.02 
 
 		 1023 aa  1542    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1389  acriflavin resistance protein  75.34 
 
 		 1022 aa  1547    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1594  acriflavin resistance protein  36.8 
 
 		 1037 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1245  acriflavin resistance protein  74.93 
 
 		 1026 aa  1530    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1315  acriflavin resistance protein  74.93 
 
 		 1026 aa  1530    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0188093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  76.38 
 
 		 1021 aa  1583    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1065  acriflavin resistance protein  38.02 
 
 		 1049 aa  707    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1295  acriflavin resistance protein  75.32 
 
 		 1026 aa  1536    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2974  acriflavin resistance protein  74.75 
 
 		 1022 aa  1538    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2343  acriflavin resistance protein  72.28 
 
 		 1022 aa  1435    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0250  efflux transporter  40.83 
 
 		 830 aa  595  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1008 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1019 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1014 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.67 
 
 		 1019 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1035 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  28.6 
 
 		 1019 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1019 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1020 aa  373  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1017 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1012 aa  362  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1021 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1021 aa  354  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1009 aa  353  7e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1022 aa  353  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.84 
 
 		 1027 aa  352  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  26.86 
 
 		 1025 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1021 aa  351  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  26.86 
 
 		 1025 aa  351  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1021 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1009 aa  347  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1046 aa  347  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.64 
 
 		 1010 aa  346  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1028 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  27.94 
 
 		 1025 aa  344  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1020 aa  344  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1022 aa  343  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.19 
 
 		 1016 aa  343  9e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1026 aa  343  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1030 aa  342  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1046 aa  341  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1044 aa  341  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1019 aa  341  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  25.24 
 
 		 1046 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.22 
 
 		 1028 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  27.91 
 
 		 1014 aa  337  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1029 aa  337  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1024 aa  337  9e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1028 aa  337  9e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1027 aa  335  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1053 aa  334  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1046 aa  335  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1051 aa  334  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  27.34 
 
 		 1015 aa  334  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  25.97 
 
 		 1022 aa  332  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1041 aa  331  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1056 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1027 aa  330  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1029 aa  330  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1041 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1029 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1029 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1029 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1029 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1013 aa  327  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1024 aa  327  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1035 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1029 aa  327  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1035 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1029 aa  325  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 1045 aa  325  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1024 aa  323  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1023 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8532  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1036 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1023 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1013 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.86 
 
 		 1014 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0427  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1012 aa  322  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161139  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6293  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 1045 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258063  hitchhiker  0.00869954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1028 aa  321  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1026 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1025 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1047 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5036  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1048 aa  320  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.809284 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6579  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1045 aa  320  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521516  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1047 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1023 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1018 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5363  acriflavin resistance protein  24.28 
 
 		 1025 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0668408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>