More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0771 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  40.39 
 
 		 1034 aa  730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  34.53 
 
 		 1045 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  41.4 
 
 		 1034 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.88 
 
 		 1053 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  36.56 
 
 		 1048 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  40.29 
 
 		 1062 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.39 
 
 		 1054 aa  706    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.84 
 
 		 1032 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  38.42 
 
 		 1033 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  34.79 
 
 		 1066 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  37.12 
 
 		 1016 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  38.88 
 
 		 1049 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1069 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  37.52 
 
 		 1047 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.99 
 
 		 1064 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  40.23 
 
 		 1070 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  36.56 
 
 		 1038 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.55 
 
 		 1066 aa  745    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  37.91 
 
 		 1040 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  39.48 
 
 		 1075 aa  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  37.3 
 
 		 1062 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.69 
 
 		 1060 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.9 
 
 		 1053 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.72 
 
 		 1077 aa  706    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.91 
 
 		 1049 aa  696    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.31 
 
 		 1052 aa  689    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.76 
 
 		 1054 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  39.69 
 
 		 1036 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  36.35 
 
 		 1455 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  38.93 
 
 		 1076 aa  730    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  42.52 
 
 		 1032 aa  818    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  37.02 
 
 		 1061 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.82 
 
 		 1077 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  41.83 
 
 		 1032 aa  816    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  38.44 
 
 		 1045 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  39.14 
 
 		 1038 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.65 
 
 		 1075 aa  694    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1047 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  35.28 
 
 		 1017 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.2 
 
 		 1059 aa  714    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.91 
 
 		 1077 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 		 1048 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.83 
 
 		 1077 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  40.66 
 
 		 1045 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  36.13 
 
 		 1047 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  36.78 
 
 		 1062 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  37.82 
 
 		 1040 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  37.66 
 
 		 1050 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.59 
 
 		 1017 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.42 
 
 		 1070 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.43 
 
 		 1049 aa  685    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  39.61 
 
 		 1034 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  38.56 
 
 		 1028 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  37.74 
 
 		 1065 aa  749    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  39.55 
 
 		 1064 aa  754    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  37.29 
 
 		 1037 aa  691    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  36.61 
 
 		 1021 aa  663    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  38.62 
 
 		 1040 aa  694    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  40.27 
 
 		 1068 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  36.29 
 
 		 1060 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  36.68 
 
 		 1058 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.37 
 
 		 1077 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  37.27 
 
 		 1022 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  40.08 
 
 		 1068 aa  715    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  40.29 
 
 		 1032 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  39.56 
 
 		 1075 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  37.61 
 
 		 1040 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  38.99 
 
 		 1046 aa  718    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  38.16 
 
 		 1043 aa  715    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  36.75 
 
 		 1038 aa  666    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  37.01 
 
 		 1035 aa  669    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.34 
 
 		 1031 aa  709    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  40.43 
 
 		 1070 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  38.27 
 
 		 1040 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  36.91 
 
 		 1046 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  37.06 
 
 		 1083 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  39.06 
 
 		 1077 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  39.39 
 
 		 1066 aa  735    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  37.96 
 
 		 1070 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  38.02 
 
 		 1048 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  36.25 
 
 		 1070 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  37.86 
 
 		 1056 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 		 1026 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  35.18 
 
 		 1017 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  35.08 
 
 		 1017 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  36.56 
 
 		 1069 aa  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  36.49 
 
 		 1072 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  38.22 
 
 		 1051 aa  702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  34.11 
 
 		 1079 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  37.34 
 
 		 1063 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  40.43 
 
 		 1070 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.88 
 
 		 1053 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  37.92 
 
 		 1023 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.92 
 
 		 1043 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.51 
 
 		 1070 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  36.91 
 
 		 1046 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.91 
 
 		 1077 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.82 
 
 		 1077 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.82 
 
 		 1077 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.51 
 
 		 1070 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>