More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3766 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.22 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.22 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  37.51 
 
 		 1034 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  88.4 
 
 		 1017 aa  1799    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  37.48 
 
 		 1034 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2709  CzcA family heavy metal efflux protein  51.13 
 
 		 1031 aa  953    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.3 
 
 		 1053 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  35.92 
 
 		 1048 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.76 
 
 		 1077 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.95 
 
 		 1077 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.69 
 
 		 1032 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  39.16 
 
 		 1033 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  36.72 
 
 		 1061 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  37.91 
 
 		 1040 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  35.61 
 
 		 1060 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  53.5 
 
 		 1016 aa  1018    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  39.26 
 
 		 1049 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3918  CzcA family heavy metal efflux protein  45.71 
 
 		 1038 aa  854    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00256702  normal  0.0818754 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  37.28 
 
 		 1064 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  61.68 
 
 		 1024 aa  1254    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  36.2 
 
 		 1038 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.21 
 
 		 1053 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  36.26 
 
 		 1037 aa  658    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  35.65 
 
 		 1044 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.66 
 
 		 1053 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.41 
 
 		 1077 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  88.89 
 
 		 1017 aa  1806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3712  CzcA family heavy metal efflux protein  52 
 
 		 1023 aa  961    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  37.9 
 
 		 1040 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.84 
 
 		 1049 aa  706    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.18 
 
 		 1052 aa  683    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  88.89 
 
 		 1017 aa  1804    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.33 
 
 		 1054 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  40.6 
 
 		 1036 aa  683    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1680  CzcA family heavy metal efflux protein  48.45 
 
 		 1042 aa  905    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.95 
 
 		 1077 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  38.07 
 
 		 1032 aa  681    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  87.61 
 
 		 1017 aa  1774    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.22 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  38.46 
 
 		 1032 aa  690    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  53.01 
 
 		 1028 aa  983    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  88.59 
 
 		 1017 aa  1819    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  39.13 
 
 		 1038 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 		 1075 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  47.97 
 
 		 1037 aa  904    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  50.75 
 
 		 1023 aa  916    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.16 
 
 		 1059 aa  711    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  37.41 
 
 		 1062 aa  685    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.95 
 
 		 1077 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  38.41 
 
 		 1045 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  39.36 
 
 		 1029 aa  739    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  36.06 
 
 		 1062 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.23 
 
 		 1050 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  35.82 
 
 		 1048 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.12 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.76 
 
 		 1077 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.5 
 
 		 1034 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  51.23 
 
 		 1028 aa  994    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.77 
 
 		 1065 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  36.68 
 
 		 1064 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.37 
 
 		 1051 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  46.58 
 
 		 1021 aa  944    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  39.81 
 
 		 1040 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.76 
 
 		 1077 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  36.84 
 
 		 1058 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.51 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  39.37 
 
 		 1022 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.03 
 
 		 1054 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  50.34 
 
 		 1026 aa  951    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  88.59 
 
 		 1017 aa  1821    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  88.79 
 
 		 1017 aa  1823    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.3 
 
 		 1053 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  37.84 
 
 		 1043 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  36.28 
 
 		 1038 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 		 1031 aa  752    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0387  CzcA family heavy metal efflux protein  35.99 
 
 		 1051 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.63 
 
 		 1040 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.7 
 
 		 1046 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.33 
 
 		 1455 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.68 
 
 		 1083 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  36.89 
 
 		 1032 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  35.89 
 
 		 1070 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  37.2 
 
 		 1070 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  36.93 
 
 		 1056 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  49.66 
 
 		 1026 aa  957    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  35.92 
 
 		 1069 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  36.34 
 
 		 1072 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6240  putative cation efflux system protein  49 
 
 		 1025 aa  925    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.7 
 
 		 1063 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  36.12 
 
 		 1076 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  36.11 
 
 		 1048 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3011  heavy metal efflux pump CzcA  50.38 
 
 		 1009 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0135257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  39.86 
 
 		 1023 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  37.14 
 
 		 1043 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  36.78 
 
 		 1069 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  36.5 
 
 		 1062 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  37.29 
 
 		 1046 aa  657    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3984  CzcA family heavy metal efflux protein  35.83 
 
 		 1069 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.544325  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 		 1017 aa  2026    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.89 
 
 		 1048 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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