More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1955 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  61.57 
 
 		 1038 aa  1262    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  40.09 
 
 		 1062 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  41.98 
 
 		 1034 aa  803    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  35.2 
 
 		 1045 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  42.03 
 
 		 1034 aa  785    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  61.27 
 
 		 1053 aa  1303    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  59.89 
 
 		 1048 aa  1249    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1017 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 		 1021 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  41.14 
 
 		 1032 aa  753    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  40.71 
 
 		 1033 aa  770    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.94 
 
 		 1481 aa  795    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  34.67 
 
 		 1066 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1017 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1016 aa  703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  41.09 
 
 		 1049 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  58.63 
 
 		 1064 aa  1217    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  37.3 
 
 		 1024 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  69.44 
 
 		 1038 aa  1425    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  39.61 
 
 		 1066 aa  744    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  40.15 
 
 		 1075 aa  714    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  60.19 
 
 		 1053 aa  1264    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  59.1 
 
 		 1077 aa  1245    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  60.12 
 
 		 1070 aa  1269    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  60.79 
 
 		 1049 aa  1293    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  60.64 
 
 		 1052 aa  1267    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  60 
 
 		 1054 aa  1267    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  40.96 
 
 		 1036 aa  731    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  36.99 
 
 		 1033 aa  669    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  40.06 
 
 		 1029 aa  736    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  40.1 
 
 		 1032 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  34.26 
 
 		 1051 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  35.04 
 
 		 1044 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 		 1032 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  38.76 
 
 		 1028 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  39.4 
 
 		 1039 aa  703    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  40.52 
 
 		 1038 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  59.47 
 
 		 1075 aa  1250    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 		 1037 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  62.57 
 
 		 1045 aa  1284    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  61.1 
 
 		 1059 aa  1301    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  35.09 
 
 		 1060 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  61.57 
 
 		 1066 aa  1263    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  46.19 
 
 		 1455 aa  887    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  59.29 
 
 		 1077 aa  1250    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  43.02 
 
 		 1045 aa  768    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  58.74 
 
 		 1047 aa  1213    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  59.75 
 
 		 1062 aa  1253    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  40.04 
 
 		 1070 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  59.25 
 
 		 1050 aa  1266    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  60.12 
 
 		 1070 aa  1269    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  60.5 
 
 		 1070 aa  1269    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  34.91 
 
 		 1045 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  41.75 
 
 		 1034 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  41.9 
 
 		 1028 aa  783    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  39.55 
 
 		 1065 aa  756    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  40.39 
 
 		 1064 aa  768    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  59.81 
 
 		 1037 aa  1255    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  36.1 
 
 		 1021 aa  686    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  40.94 
 
 		 1040 aa  771    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  62.63 
 
 		 1046 aa  1276    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  37.66 
 
 		 1019 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  60.21 
 
 		 1058 aa  1236    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  58.81 
 
 		 1077 aa  1240    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  41.98 
 
 		 1022 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3857  heavy metal efflux pump CzcA  41.11 
 
 		 1045 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  60.6 
 
 		 1047 aa  1256    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  40.14 
 
 		 1026 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  49.48 
 
 		 1083 aa  1030    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  34.26 
 
 		 1043 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  44.35 
 
 		 1456 aa  855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  100 
 
 		 1043 aa  2097    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  71.62 
 
 		 1038 aa  1499    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  41.24 
 
 		 1031 aa  789    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  39.53 
 
 		 1029 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  58.08 
 
 		 1040 aa  1227    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  58.95 
 
 		 1046 aa  1220    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  40.62 
 
 		 1046 aa  756    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  57.95 
 
 		 1083 aa  1243    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  39.41 
 
 		 1077 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  60.15 
 
 		 1070 aa  1251    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  60.09 
 
 		 1070 aa  1267    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  60.91 
 
 		 1056 aa  1261    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  39.69 
 
 		 1026 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  70.67 
 
 		 1037 aa  1462    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  35.82 
 
 		 1065 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  60.78 
 
 		 1069 aa  1288    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  61.43 
 
 		 1072 aa  1284    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  51.08 
 
 		 1079 aa  1061    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  59.62 
 
 		 1063 aa  1260    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  37.32 
 
 		 1017 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  47.88 
 
 		 1076 aa  971    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  47.6 
 
 		 1076 aa  988    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  40.23 
 
 		 1023 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  60.42 
 
 		 1043 aa  1281    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  40.99 
 
 		 1035 aa  713    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  40.23 
 
 		 1070 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  50.24 
 
 		 1075 aa  993    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  40.13 
 
 		 1070 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  51.7 
 
 		 1078 aa  1029    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>