More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1113 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



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Alignment on homolog gene

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  46.51 
 
 
1034 aa  921    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  36.58 
 
 
1045 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  47.08 
 
 
1034 aa  926    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  40.49 
 
 
1038 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  43.05 
 
 
1053 aa  822    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  42.64 
 
 
1048 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  37.28 
 
 
1032 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  43.19 
 
 
1021 aa  757    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  65.87 
 
 
1032 aa  1320    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  63.03 
 
 
1033 aa  1341    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  39.77 
 
 
1017 aa  742    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  35.61 
 
 
1066 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  40.1 
 
 
1035 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  42.61 
 
 
1016 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  64.71 
 
 
1049 aa  1254    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.44 
 
 
1038 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 
1070 aa  725    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  41.63 
 
 
1064 aa  795    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  37.99 
 
 
1024 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  39.75 
 
 
1038 aa  718    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.02 
 
 
1066 aa  723    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  39.43 
 
 
1075 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  42.83 
 
 
1053 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  42.86 
 
 
1077 aa  810    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  38.22 
 
 
1456 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.57 
 
 
1071 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  42.39 
 
 
1070 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  42.83 
 
 
1049 aa  815    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  42.52 
 
 
1052 aa  801    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  38.15 
 
 
1081 aa  697    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  42.63 
 
 
1054 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  66.63 
 
 
1036 aa  1301    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.41 
 
 
1033 aa  709    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.74 
 
 
1029 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  43.09 
 
 
1032 aa  809    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  36.05 
 
 
1051 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  43.06 
 
 
1032 aa  805    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  46.11 
 
 
1028 aa  766    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  38.71 
 
 
1039 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  66.83 
 
 
1038 aa  1321    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  42.56 
 
 
1075 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  40.14 
 
 
1037 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  42.97 
 
 
1023 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  42.17 
 
 
1059 aa  802    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  41.83 
 
 
1066 aa  757    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  42.87 
 
 
1077 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  65.41 
 
 
1045 aa  1309    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  40.86 
 
 
1047 aa  754    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  41.6 
 
 
1062 aa  766    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  41.3 
 
 
1050 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  39.77 
 
 
1017 aa  742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  42.3 
 
 
1070 aa  819    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  37.15 
 
 
1045 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  46.03 
 
 
1034 aa  897    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  42.5 
 
 
1028 aa  771    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  38.11 
 
 
1065 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  38.96 
 
 
1064 aa  738    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  38.82 
 
 
1037 aa  698    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  39.08 
 
 
1021 aa  724    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 
1040 aa  2061    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  34.44 
 
 
1059 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.82 
 
 
1019 aa  737    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  41.13 
 
 
1058 aa  749    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  43.27 
 
 
1077 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  46.08 
 
 
1022 aa  808    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  35.97 
 
 
1051 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  43.41 
 
 
1026 aa  745    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  38.97 
 
 
1083 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  35.78 
 
 
1043 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  41.48 
 
 
1046 aa  743    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  40.94 
 
 
1043 aa  773    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  40.54 
 
 
1038 aa  750    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  65.29 
 
 
1031 aa  1344    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.86 
 
 
1481 aa  641    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  42.76 
 
 
1040 aa  815    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  41.52 
 
 
1046 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  39.02 
 
 
1070 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  42.18 
 
 
1083 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  38.53 
 
 
1077 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  41.67 
 
 
1070 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  42.65 
 
 
1070 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  41.46 
 
 
1056 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  43.46 
 
 
1026 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  37.02 
 
 
1060 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  39.31 
 
 
1062 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  40.89 
 
 
1069 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  41.63 
 
 
1072 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  39.75 
 
 
1037 aa  725    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  40.76 
 
 
1079 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  39.24 
 
 
1455 aa  754    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  42.57 
 
 
1063 aa  804    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  38.09 
 
 
1076 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  38.27 
 
 
1076 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  66.73 
 
 
1023 aa  1355    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  42.41 
 
 
1043 aa  828    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  39.52 
 
 
1017 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  35.67 
 
 
1045 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  38.04 
 
 
1039 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
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NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  36.86 
 
 
1027 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
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NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  39.53 
 
 
1075 aa  706    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
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