More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0614 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  35.58 
 
 
1047 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.58 
 
 
1047 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  43.33 
 
 
1034 aa  845    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  37.04 
 
 
1045 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  43.01 
 
 
1034 aa  825    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  64.22 
 
 
1053 aa  1387    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  63.58 
 
 
1048 aa  1329    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  42.03 
 
 
1021 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  42.94 
 
 
1032 aa  762    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  42.12 
 
 
1033 aa  790    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  35.82 
 
 
1033 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  36.41 
 
 
1066 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  40.31 
 
 
1016 aa  700    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  41.91 
 
 
1049 aa  713    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.8 
 
 
1038 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  61.67 
 
 
1064 aa  1290    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  57.12 
 
 
1038 aa  1216    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.71 
 
 
1066 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  39.85 
 
 
1075 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  63.72 
 
 
1053 aa  1358    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  36.59 
 
 
1070 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  62.69 
 
 
1077 aa  1317    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.65 
 
 
1481 aa  790    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  62.48 
 
 
1049 aa  1360    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  63.12 
 
 
1052 aa  1351    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  63.93 
 
 
1054 aa  1364    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  42.28 
 
 
1036 aa  739    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  37.68 
 
 
1033 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  37.97 
 
 
1029 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  39.38 
 
 
1032 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  36.19 
 
 
1051 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  37.57 
 
 
1044 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  39.54 
 
 
1032 aa  721    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  40.54 
 
 
1028 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  37.62 
 
 
1039 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  42.27 
 
 
1038 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  62.07 
 
 
1075 aa  1343    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  40.67 
 
 
1037 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  42.05 
 
 
1023 aa  685    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  62.79 
 
 
1059 aa  1359    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  74.32 
 
 
1066 aa  1567    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  36.61 
 
 
1070 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  62.98 
 
 
1077 aa  1324    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  43.11 
 
 
1045 aa  776    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  59.25 
 
 
1047 aa  1249    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  61.57 
 
 
1062 aa  1301    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  35.34 
 
 
1067 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  63.62 
 
 
1050 aa  1377    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  33.78 
 
 
1074 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  63.07 
 
 
1070 aa  1319    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  35.79 
 
 
1045 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  43.8 
 
 
1034 aa  840    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  39.54 
 
 
1028 aa  714    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  39.01 
 
 
1065 aa  744    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  38.79 
 
 
1064 aa  720    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  53.69 
 
 
1037 aa  1153    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  35.45 
 
 
1021 aa  676    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  41.53 
 
 
1040 aa  792    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  34.44 
 
 
1059 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  39.64 
 
 
1019 aa  704    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  59.49 
 
 
1058 aa  1251    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  62.06 
 
 
1077 aa  1317    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  43.9 
 
 
1022 aa  753    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3857  heavy metal efflux pump CzcA  40.53 
 
 
1045 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  41.37 
 
 
1026 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  52.17 
 
 
1083 aa  1095    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  35.4 
 
 
1043 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  45.56 
 
 
1455 aa  889    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  61.57 
 
 
1043 aa  1295    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  57.66 
 
 
1038 aa  1217    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  36.83 
 
 
1032 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  42.56 
 
 
1031 aa  808    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  39.43 
 
 
1029 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  60.27 
 
 
1040 aa  1309    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  63.08 
 
 
1046 aa  1308    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  43.38 
 
 
1456 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  61.54 
 
 
1083 aa  1303    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  39.05 
 
 
1077 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  78.08 
 
 
1070 aa  1648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  75.21 
 
 
1070 aa  1614    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  78.15 
 
 
1056 aa  1634    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  41.3 
 
 
1026 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  36.72 
 
 
1065 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  78.54 
 
 
1069 aa  1685    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  75.14 
 
 
1072 aa  1611    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  55.17 
 
 
1079 aa  1154    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  61.81 
 
 
1063 aa  1327    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  49.86 
 
 
1076 aa  1026    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  50.09 
 
 
1076 aa  1064    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  43.2 
 
 
1023 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  63.07 
 
 
1043 aa  1344    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  35.73 
 
 
1045 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.65 
 
 
1039 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  51.96 
 
 
1075 aa  1037    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  35.69 
 
 
1047 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  53.25 
 
 
1078 aa  1081    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  49.91 
 
 
1081 aa  1051    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  62.88 
 
 
1070 aa  1319    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  36.93 
 
 
1068 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  56.3 
 
 
1037 aa  1198    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>