More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1306 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.47 
 
 
1070 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  38.04 
 
 
1070 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  37.72 
 
 
1034 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.97 
 
 
1077 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  37.79 
 
 
1034 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  39.11 
 
 
1053 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  39.31 
 
 
1048 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  39.17 
 
 
1046 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  43.67 
 
 
1021 aa  801    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 
1032 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  39.59 
 
 
1033 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  40.16 
 
 
1033 aa  724    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  39.52 
 
 
1061 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  38.7 
 
 
1032 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  39.88 
 
 
1051 aa  697    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  39.39 
 
 
1049 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  38.71 
 
 
1038 aa  715    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  39.52 
 
 
1064 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  38.07 
 
 
1038 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  38.6 
 
 
1036 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 
1053 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  39.47 
 
 
1053 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.88 
 
 
1077 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  38.94 
 
 
1049 aa  706    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  39 
 
 
1052 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  39.61 
 
 
1054 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  40.04 
 
 
1036 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  42.73 
 
 
1033 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  42.7 
 
 
1029 aa  783    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  41.15 
 
 
1083 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  38.34 
 
 
1060 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  39.21 
 
 
1048 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7181  heavy metal efflux pump CzcA  39.21 
 
 
1062 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  39.06 
 
 
1069 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.02 
 
 
1039 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  39.78 
 
 
1038 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  38.92 
 
 
1075 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  39.26 
 
 
1054 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.9 
 
 
1059 aa  696    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  38.84 
 
 
1066 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  41.36 
 
 
1050 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  38.73 
 
 
1077 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  40.38 
 
 
1045 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  39.3 
 
 
1047 aa  691    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  38.56 
 
 
1062 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  39.07 
 
 
1077 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  38.89 
 
 
1050 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  38.48 
 
 
1070 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.97 
 
 
1077 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.72 
 
 
1034 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 
1028 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  41.91 
 
 
1040 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 
1034 aa  752    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  39.98 
 
 
1040 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  41.09 
 
 
1079 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  38.68 
 
 
1040 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  43.46 
 
 
1019 aa  812    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  39.69 
 
 
1058 aa  660    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.63 
 
 
1077 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  39.51 
 
 
1040 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  36.87 
 
 
1062 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  42.12 
 
 
1040 aa  788    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 
1070 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  40.35 
 
 
1048 aa  695    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.97 
 
 
1077 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  39.69 
 
 
1043 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  38.91 
 
 
1038 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  39.84 
 
 
1031 aa  717    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 
1029 aa  2061    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  39.11 
 
 
1040 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  39.92 
 
 
1046 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  38.99 
 
 
1045 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  38.47 
 
 
1083 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  41.35 
 
 
1032 aa  775    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  39.54 
 
 
1070 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  38.63 
 
 
1070 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  38.84 
 
 
1056 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  39.58 
 
 
1062 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  37.15 
 
 
1046 aa  665    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  39.07 
 
 
1069 aa  701    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  39.37 
 
 
1072 aa  688    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 
1070 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  36.79 
 
 
1079 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  42.73 
 
 
1050 aa  794    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  39.33 
 
 
1063 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  38.92 
 
 
1060 aa  651    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  36.41 
 
 
1076 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  39.94 
 
 
1023 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  38.51 
 
 
1043 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  43.09 
 
 
1045 aa  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  38.29 
 
 
1039 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  40.24 
 
 
1027 aa  759    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  37.04 
 
 
1032 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  37.94 
 
 
1455 aa  681    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  39.07 
 
 
1077 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  58.5 
 
 
1025 aa  1167    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 
1070 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  39.17 
 
 
1037 aa  661    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  42.25 
 
 
1032 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  43.78 
 
 
1028 aa  802    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>