More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02377 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  36.08 
 
 		 1034 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  37.72 
 
 		 1048 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  35.79 
 
 		 1034 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  38.33 
 
 		 1061 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.2 
 
 		 1053 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  37.14 
 
 		 1048 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 		 1029 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.71 
 
 		 1021 aa  776    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  37.18 
 
 		 1032 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.13 
 
 		 1033 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.26 
 
 		 1033 aa  715    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.97 
 
 		 1454 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  43.63 
 
 		 1032 aa  843    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  65.69 
 
 		 1030 aa  1324    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.56 
 
 		 1025 aa  752    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  100 
 
 		 1038 aa  2089    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  38.53 
 
 		 1064 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  36.96 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.46 
 
 		 1054 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 		 1053 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.78 
 
 		 1031 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.6 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.57 
 
 		 1077 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  38.65 
 
 		 1049 aa  719    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.86 
 
 		 1052 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  37.45 
 
 		 1054 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  36.2 
 
 		 1061 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.97 
 
 		 1033 aa  723    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.65 
 
 		 1029 aa  750    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.66 
 
 		 1038 aa  721    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.95 
 
 		 1070 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.15 
 
 		 1034 aa  693    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.69 
 
 		 1032 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.37 
 
 		 1039 aa  779    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.68 
 
 		 1439 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  37.12 
 
 		 1075 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.93 
 
 		 1025 aa  713    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.78 
 
 		 1033 aa  1009    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  39.37 
 
 		 1059 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  37.14 
 
 		 1048 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.31 
 
 		 1062 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.67 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.25 
 
 		 1045 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.12 
 
 		 1040 aa  693    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 		 1053 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.57 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.79 
 
 		 1050 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.95 
 
 		 1070 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.89 
 
 		 1034 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.47 
 
 		 1034 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  36.18 
 
 		 1028 aa  641    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  36.41 
 
 		 1063 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.95 
 
 		 1070 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  36.73 
 
 		 1034 aa  736    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37 
 
 		 1040 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.54 
 
 		 1456 aa  645    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  41.45 
 
 		 1019 aa  805    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.08 
 
 		 1034 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.77 
 
 		 1077 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  65.45 
 
 		 1057 aa  1281    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  37.92 
 
 		 1032 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  37.28 
 
 		 1046 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  37.36 
 
 		 1040 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.67 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.43 
 
 		 1052 aa  684    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.47 
 
 		 1459 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.68 
 
 		 1458 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.05 
 
 		 1062 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.43 
 
 		 1063 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.18 
 
 		 1031 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.6 
 
 		 1029 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.38 
 
 		 1040 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  37.63 
 
 		 1046 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.52 
 
 		 1083 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  37.07 
 
 		 1032 aa  726    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.1 
 
 		 1053 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.57 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2297  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 		 1080 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.04 
 
 		 1042 aa  1400    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  35.65 
 
 		 1459 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.51 
 
 		 1028 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  37.14 
 
 		 1048 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.78 
 
 		 1031 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.03 
 
 		 1051 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.57 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  37.15 
 
 		 1079 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  36.66 
 
 		 1050 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  37.33 
 
 		 1063 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.03 
 
 		 1039 aa  730    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.48 
 
 		 1031 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  36.5 
 
 		 1023 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  38.21 
 
 		 1043 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  34.83 
 
 		 1455 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  36.28 
 
 		 1045 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  85.29 
 
 		 1039 aa  1786    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.96 
 
 		 1027 aa  730    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  40.46 
 
 		 1036 aa  788    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  37.31 
 
 		 1034 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.67 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.95 
 
 		 1070 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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