More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0580 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  38.39 
 
 		 1034 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.41 
 
 		 1025 aa  778    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.9 
 
 		 1034 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.64 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  36.4 
 
 		 1048 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  43.55 
 
 		 1021 aa  818    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  38.02 
 
 		 1040 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.41 
 
 		 1033 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  40.41 
 
 		 1033 aa  764    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  67.86 
 
 		 1032 aa  1485    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  37.56 
 
 		 1032 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  51.99 
 
 		 1034 aa  1132    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.44 
 
 		 1038 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.26 
 
 		 1064 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  36.42 
 
 		 1040 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.78 
 
 		 1040 aa  738    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  38.06 
 
 		 1048 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.73 
 
 		 1053 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  37.37 
 
 		 1077 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1029 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.07 
 
 		 1049 aa  672    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.42 
 
 		 1052 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 		 1054 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.62 
 
 		 1054 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.64 
 
 		 1033 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  41.59 
 
 		 1029 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.72 
 
 		 1032 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.17 
 
 		 1034 aa  728    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  38.09 
 
 		 1079 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  36.57 
 
 		 1032 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.61 
 
 		 1039 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.35 
 
 		 1051 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.64 
 
 		 1075 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.92 
 
 		 1059 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  37.65 
 
 		 1063 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  39.27 
 
 		 1050 aa  746    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.66 
 
 		 1077 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.23 
 
 		 1055 aa  713    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  36 
 
 		 1047 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  36.07 
 
 		 1062 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.64 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.77 
 
 		 1050 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  39.04 
 
 		 1025 aa  714    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.68 
 
 		 1070 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  35.3 
 
 		 1045 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.45 
 
 		 1034 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  40.93 
 
 		 1049 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.78 
 
 		 1034 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  37.07 
 
 		 1057 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.27 
 
 		 1062 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.38 
 
 		 1046 aa  653    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  36.9 
 
 		 1040 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1070 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  43.84 
 
 		 1019 aa  844    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  36.05 
 
 		 1446 aa  635    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.61 
 
 		 1077 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1056 aa  740    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  38.98 
 
 		 1040 aa  740    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.72 
 
 		 1063 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.29 
 
 		 1031 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  37.28 
 
 		 1455 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  36.41 
 
 		 1043 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  37.05 
 
 		 1083 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  38.36 
 
 		 1062 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.52 
 
 		 1031 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.75 
 
 		 1029 aa  738    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3079  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.12 
 
 		 1045 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.931576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 		 1046 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.46 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  37.13 
 
 		 1083 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.66 
 
 		 1077 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.61 
 
 		 1054 aa  720    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.55 
 
 		 1053 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 		 1048 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 		 1048 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  36.56 
 
 		 1459 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.35 
 
 		 1069 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  37.05 
 
 		 1030 aa  680    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.64 
 
 		 1053 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  35.2 
 
 		 1048 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  39.88 
 
 		 1050 aa  778    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.53 
 
 		 1063 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.61 
 
 		 1054 aa  720    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.98 
 
 		 1056 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.68 
 
 		 1043 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  39.37 
 
 		 1045 aa  775    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.71 
 
 		 1039 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  40.66 
 
 		 1027 aa  815    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  38.34 
 
 		 1036 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  38.56 
 
 		 1032 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.66 
 
 		 1077 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  39.48 
 
 		 1040 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  41.4 
 
 		 1028 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  37.46 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
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NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.16 
 
 		 1456 aa  653    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
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NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  62.37 
 
 		 1032 aa  1292    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
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