More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1813 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 1034 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1040 aa  2104    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  36.47 
 
 		 1034 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  35.9 
 
 		 1053 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.6 
 
 		 1469 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  39.8 
 
 		 1021 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  35.9 
 
 		 1053 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.87 
 
 		 1025 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  40.06 
 
 		 1033 aa  743    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.52 
 
 		 1060 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 		 1032 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.84 
 
 		 1462 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.12 
 
 		 1038 aa  682    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.07 
 
 		 1037 aa  1096    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  36.37 
 
 		 1057 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.74 
 
 		 1034 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.42 
 
 		 1053 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.21 
 
 		 1049 aa  673    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.58 
 
 		 1049 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.95 
 
 		 1052 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.05 
 
 		 1054 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.37 
 
 		 1056 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.18 
 
 		 1033 aa  712    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  37.39 
 
 		 1029 aa  721    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.18 
 
 		 1047 aa  650    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  39.02 
 
 		 1056 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.77 
 
 		 1031 aa  723    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.77 
 
 		 1031 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  38.13 
 
 		 1063 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1039 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.9 
 
 		 1053 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.89 
 
 		 1458 aa  661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  53.41 
 
 		 1032 aa  1093    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 		 1051 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.47 
 
 		 1054 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  38.61 
 
 		 1050 aa  699    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.47 
 
 		 1054 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  36.46 
 
 		 1455 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.67 
 
 		 1050 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  49.56 
 
 		 1032 aa  1051    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1070 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.35 
 
 		 1439 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.28 
 
 		 1034 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1070 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1070 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.33 
 
 		 1055 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  36.9 
 
 		 1034 aa  690    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.84 
 
 		 1019 aa  775    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.81 
 
 		 1053 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.87 
 
 		 1043 aa  1070    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  35.09 
 
 		 1030 aa  661    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  39.81 
 
 		 1049 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  40.06 
 
 		 1040 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  35.61 
 
 		 1036 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.07 
 
 		 1039 aa  1085    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.16 
 
 		 1079 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.93 
 
 		 1034 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  36.56 
 
 		 1032 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.17 
 
 		 1480 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.22 
 
 		 1040 aa  1084    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  39.84 
 
 		 1029 aa  731    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.83 
 
 		 1042 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  36.62 
 
 		 1046 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 		 1459 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.89 
 
 		 1034 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1070 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.62 
 
 		 1040 aa  726    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  40.57 
 
 		 1025 aa  721    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.72 
 
 		 1031 aa  1106    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.17 
 
 		 1450 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.38 
 
 		 1459 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  37.88 
 
 		 1028 aa  738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.7 
 
 		 1038 aa  1139    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  39.01 
 
 		 1050 aa  731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.22 
 
 		 1032 aa  1105    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.83 
 
 		 1443 aa  650    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  39.34 
 
 		 1045 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  35.58 
 
 		 1039 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.79 
 
 		 1027 aa  769    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.33 
 
 		 1055 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.02 
 
 		 1056 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.07 
 
 		 1046 aa  1119    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  68.68 
 
 		 1034 aa  1472    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1070 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  39.96 
 
 		 1040 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  35.78 
 
 		 1083 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.43 
 
 		 1077 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.43 
 
 		 1077 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.77 
 
 		 1083 aa  635  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.43 
 
 		 1077 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  35.85 
 
 		 1048 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.07 
 
 		 1454 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34 
 
 		 1052 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.48 
 
 		 1063 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  35.84 
 
 		 1048 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  36.83 
 
 		 1456 aa  631  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  36.11 
 
 		 1446 aa  626  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.33 
 
 		 1077 aa  629  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.33 
 
 		 1077 aa  629  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  35.24 
 
 		 1043 aa  628  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
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