More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3726 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.29 
 
 		 1077 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  37.43 
 
 		 1034 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  36.5 
 
 		 1057 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  37.12 
 
 		 1034 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  35.27 
 
 		 1053 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  35.12 
 
 		 1048 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  40.55 
 
 		 1025 aa  746    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  44.17 
 
 		 1021 aa  860    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  35.67 
 
 		 1032 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.76 
 
 		 1033 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.99 
 
 		 1033 aa  761    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 		 1077 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.47 
 
 		 1032 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  42.9 
 
 		 1049 aa  815    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  38.38 
 
 		 1083 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.26 
 
 		 1038 aa  748    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.55 
 
 		 1064 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 		 1077 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.17 
 
 		 1054 aa  768    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 1048 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.22 
 
 		 1075 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.92 
 
 		 1053 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.01 
 
 		 1077 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.1 
 
 		 1070 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.26 
 
 		 1049 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.82 
 
 		 1052 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.51 
 
 		 1054 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  40.18 
 
 		 1056 aa  772    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.63 
 
 		 1033 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  42.43 
 
 		 1029 aa  840    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.42 
 
 		 1032 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  37.62 
 
 		 1036 aa  736    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  34.45 
 
 		 1066 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  35.95 
 
 		 1032 aa  660    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.76 
 
 		 1039 aa  822    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4682  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.39 
 
 		 1049 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.439534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  34.99 
 
 		 1075 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  36.08 
 
 		 1059 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.57 
 
 		 1068 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  41.15 
 
 		 1050 aa  805    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.29 
 
 		 1077 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.21 
 
 		 1045 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  36.88 
 
 		 1047 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.17 
 
 		 1053 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.67 
 
 		 1068 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.38 
 
 		 1050 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.72 
 
 		 1070 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.42 
 
 		 1074 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  37.39 
 
 		 1034 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 1040 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.21 
 
 		 1065 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  39.83 
 
 		 1079 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 		 1070 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.13 
 
 		 1070 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.49 
 
 		 1040 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  38.78 
 
 		 1459 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  44.53 
 
 		 1019 aa  877    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  59.38 
 
 		 1032 aa  1277    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.8 
 
 		 1077 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.33 
 
 		 1031 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  42.19 
 
 		 1040 aa  800    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.27 
 
 		 1053 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  41.3 
 
 		 1040 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 		 1077 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  34.2 
 
 		 1082 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  53.19 
 
 		 1034 aa  1134    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  41.7 
 
 		 1028 aa  837    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.32 
 
 		 1031 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.78 
 
 		 1029 aa  773    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  40.37 
 
 		 1063 aa  779    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.74 
 
 		 1046 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.35 
 
 		 1062 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.89 
 
 		 1083 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.48 
 
 		 1029 aa  658    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  39.25 
 
 		 1034 aa  736    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.76 
 
 		 1075 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  35.27 
 
 		 1053 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1070 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 		 1070 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.57 
 
 		 1068 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  35.88 
 
 		 1069 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  33.8 
 
 		 1076 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  36.73 
 
 		 1446 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  40.46 
 
 		 1050 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.23 
 
 		 1063 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  35.85 
 
 		 1054 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  36.63 
 
 		 1032 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  36.71 
 
 		 1023 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.56 
 
 		 1043 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.04 
 
 		 1070 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  40.31 
 
 		 1045 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.96 
 
 		 1039 aa  730    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 		 1027 aa  811    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  39.92 
 
 		 1455 aa  726    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.29 
 
 		 1077 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.83 
 
 		 1046 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.55 
 
 		 1070 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  34.69 
 
 		 1076 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  36.78 
 
 		 1456 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
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NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  64.02 
 
 		 1032 aa  1349    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
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