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for query gene Nwi_2911 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.76 
 
 		 1034 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.97 
 
 		 1039 aa  819    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.48 
 
 		 1459 aa  644    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  42.17 
 
 		 1021 aa  735    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.17 
 
 		 1031 aa  777    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 		 1033 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.39 
 
 		 1031 aa  730    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.85 
 
 		 1038 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.25 
 
 		 1047 aa  648    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.39 
 
 		 1031 aa  730    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.42 
 
 		 1025 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.56 
 
 		 1037 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3449  putative cation/heavy metal efflux system protein  69.65 
 
 		 547 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622093  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.92 
 
 		 1049 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.48 
 
 		 1060 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  39.22 
 
 		 1033 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.82 
 
 		 1029 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.73 
 
 		 1054 aa  1055    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  49.56 
 
 		 1063 aa  998    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.01 
 
 		 1039 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1010 aa  761    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  36.08 
 
 		 1036 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1050 aa  2103    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  70.88 
 
 		 1040 aa  1478    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.1 
 
 		 1028 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.69 
 
 		 1050 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.72 
 
 		 1032 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  71.29 
 
 		 1040 aa  1496    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.8 
 
 		 1049 aa  671    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.15 
 
 		 1040 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  37 
 
 		 1034 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.61 
 
 		 1040 aa  723    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  39.79 
 
 		 1019 aa  735    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.35 
 
 		 1056 aa  1392    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.04 
 
 		 1077 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  38.82 
 
 		 1032 aa  778    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  71.36 
 
 		 1040 aa  1503    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3452  putative cation/heavy metal efflux system protein  69.43 
 
 		 514 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  42.22 
 
 		 1029 aa  756    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.51 
 
 		 1046 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.83 
 
 		 1032 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.53 
 
 		 1025 aa  702    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.85 
 
 		 1042 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.38 
 
 		 1027 aa  768    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.94 
 
 		 1043 aa  803    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.44 
 
 		 1055 aa  1056    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.44 
 
 		 1055 aa  1055    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.44 
 
 		 1056 aa  1386    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  88.76 
 
 		 1050 aa  1882    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.73 
 
 		 1054 aa  1055    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.27 
 
 		 1038 aa  770    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  51.49 
 
 		 1045 aa  1096    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  37.7 
 
 		 1039 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.27 
 
 		 1027 aa  751    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  66.44 
 
 		 1056 aa  1387    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  38.16 
 
 		 1034 aa  755    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  61.24 
 
 		 1049 aa  1301    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  49.31 
 
 		 1079 aa  1048    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  40.17 
 
 		 1032 aa  761    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  49.4 
 
 		 1083 aa  1032    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 1032 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.04 
 
 		 1052 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.63 
 
 		 1083 aa  635  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.09 
 
 		 1462 aa  635  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.76 
 
 		 1458 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.05 
 
 		 1455 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.72 
 
 		 1034 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.15 
 
 		 1034 aa  629  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.35 
 
 		 1052 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.48 
 
 		 1439 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.24 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.97 
 
 		 1059 aa  625  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.99 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.99 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 		 1054 aa  625  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.99 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  36.71 
 
 		 1030 aa  624  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.9 
 
 		 1077 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.9 
 
 		 1077 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  38.57 
 
 		 1057 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.9 
 
 		 1077 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.8 
 
 		 1077 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5715  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.87 
 
 		 1045 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.07 
 
 		 1051 aa  618  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.15 
 
 		 1034 aa  619  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.9 
 
 		 1480 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.05 
 
 		 1051 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  36.45 
 
 		 1040 aa  615  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.8 
 
 		 1443 aa  613  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  35.65 
 
 		 1031 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  35.5 
 
 		 1034 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.34 
 
 		 1043 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
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NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  36.66 
 
 		 1032 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1238  CzcA family heavy metal efflux protein  37.57 
 
 		 1057 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.33 
 
 		 1053 aa  609  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.17 
 
 		 1054 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 		 1070 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.2 
 
 		 1456 aa  608  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
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NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.71 
 
 		 1063 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
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NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.32 
 
 		 1029 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
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