More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3687 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.83 
 
 
1039 aa  845    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.63 
 
 
1021 aa  719    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  37.75 
 
 
1033 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  35.66 
 
 
1036 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  60 
 
 
1056 aa  1272    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.74 
 
 
1031 aa  781    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  38.85 
 
 
1028 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.97 
 
 
1032 aa  838    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.23 
 
 
1459 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  41.05 
 
 
1033 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.59 
 
 
1029 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  39.35 
 
 
1039 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.81 
 
 
1040 aa  744    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  61.24 
 
 
1050 aa  1308    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  42.83 
 
 
1032 aa  803    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1049 aa  2103    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.9 
 
 
1040 aa  808    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  39.73 
 
 
1032 aa  776    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  62.09 
 
 
1040 aa  1297    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.37 
 
 
1065 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.56 
 
 
1019 aa  725    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3452  putative cation/heavy metal efflux system protein  63.08 
 
 
514 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.93 
 
 
1038 aa  783    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  60.15 
 
 
1040 aa  1268    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.55 
 
 
1025 aa  693    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.87 
 
 
1051 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.21 
 
 
1027 aa  721    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.63 
 
 
1055 aa  1056    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  48.97 
 
 
1083 aa  998    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.62 
 
 
1054 aa  1062    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  44.51 
 
 
1029 aa  782    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  49.24 
 
 
1079 aa  1021    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  39.83 
 
 
1034 aa  762    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.62 
 
 
1054 aa  1062    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  48.3 
 
 
1063 aa  991    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.09 
 
 
1031 aa  757    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 
1010 aa  747    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.71 
 
 
1040 aa  1272    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.73 
 
 
1037 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.25 
 
 
1049 aa  681    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  63.1 
 
 
1050 aa  1348    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.71 
 
 
1056 aa  1263    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.09 
 
 
1031 aa  757    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.78 
 
 
1043 aa  803    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  51.59 
 
 
1045 aa  1092    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  41.19 
 
 
1027 aa  761    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.63 
 
 
1055 aa  1055    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.1 
 
 
1462 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  59.71 
 
 
1056 aa  1262    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  41.58 
 
 
1025 aa  731    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.74 
 
 
1046 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.84 
 
 
1034 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.98 
 
 
1053 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.62 
 
 
1034 aa  635  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.73 
 
 
1038 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  38.8 
 
 
1030 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.98 
 
 
1060 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.98 
 
 
1053 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.98 
 
 
1053 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.09 
 
 
1051 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 
1053 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3449  putative cation/heavy metal efflux system protein  60.97 
 
 
547 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622093  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  36.69 
 
 
1047 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  37.69 
 
 
1083 aa  632  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.96 
 
 
1439 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.74 
 
 
1054 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  39 
 
 
1042 aa  628  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 
1050 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.05 
 
 
1032 aa  628  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.17 
 
 
1034 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.16 
 
 
1053 aa  625  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.49 
 
 
1049 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.71 
 
 
1455 aa  625  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.36 
 
 
1034 aa  621  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.04 
 
 
1480 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  36.27 
 
 
1034 aa  619  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 
1032 aa  619  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.11 
 
 
1052 aa  618  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.46 
 
 
1054 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.61 
 
 
1458 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.39 
 
 
1043 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  37.32 
 
 
1039 aa  619  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.39 
 
 
1047 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.57 
 
 
1456 aa  614  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.43 
 
 
1034 aa  612  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.09 
 
 
1077 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.52 
 
 
1034 aa  612  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.62 
 
 
1064 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.23 
 
 
1077 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.47 
 
 
1077 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.23 
 
 
1077 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.62 
 
 
1062 aa  609  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
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NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  37.38 
 
 
1048 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
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NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34.77 
 
 
1059 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.84 
 
 
1070 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.43 
 
 
1450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal 
 
 
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NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.68 
 
 
1454 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.668316 
 
 
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NC_010725  Mpop_4083  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.09 
 
 
1082 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  36.56 
 
 
1069 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  37.18 
 
 
1048 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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