More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3449 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  82.46 
 
 		 1040 aa  849    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  69.65 
 
 		 1050 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  83.83 
 
 		 1040 aa  883    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  64.87 
 
 		 1056 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  65.24 
 
 		 1056 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  84.01 
 
 		 1040 aa  888    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  69.17 
 
 		 1050 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3449  putative cation/heavy metal efflux system protein  100 
 
 		 547 aa  1097    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622093  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  65.24 
 
 		 1056 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  60.97 
 
 		 1049 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  49.35 
 
 		 1045 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.66 
 
 		 1055 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.66 
 
 		 1055 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.47 
 
 		 1054 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.47 
 
 		 1054 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  47.14 
 
 		 1079 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  48.41 
 
 		 1083 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  48.91 
 
 		 1063 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  42.5 
 
 		 1027 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.74 
 
 		 1039 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  41.88 
 
 		 1010 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.56 
 
 		 1032 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.93 
 
 		 1039 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.42 
 
 		 1037 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.81 
 
 		 1043 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.15 
 
 		 1031 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.19 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  38.72 
 
 		 1032 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  36.8 
 
 		 1032 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.55 
 
 		 1040 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.95 
 
 		 1038 aa  359  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 		 1028 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  37.13 
 
 		 1034 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.91 
 
 		 1027 aa  351  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  38.29 
 
 		 1019 aa  350  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  39.27 
 
 		 1034 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.15 
 
 		 1029 aa  349  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.91 
 
 		 1033 aa  343  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.26 
 
 		 1025 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.64 
 
 		 1047 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  39.58 
 
 		 1021 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.55 
 
 		 1040 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  37.66 
 
 		 1032 aa  334  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.2 
 
 		 1049 aa  334  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.01 
 
 		 1040 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  36.42 
 
 		 1025 aa  329  8e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.45 
 
 		 1059 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.4 
 
 		 1062 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.18 
 
 		 1458 aa  324  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  36.11 
 
 		 1061 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.13 
 
 		 1060 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.25 
 
 		 1033 aa  319  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.16 
 
 		 1051 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.12 
 
 		 1443 aa  317  5e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.68 
 
 		 1462 aa  316  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.82 
 
 		 1450 aa  315  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  33.63 
 
 		 1034 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  33.87 
 
 		 1455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  37.5 
 
 		 1029 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.52 
 
 		 1480 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.55 
 
 		 1063 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  38.05 
 
 		 1039 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.4 
 
 		 1051 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  34.55 
 
 		 1063 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.67 
 
 		 1052 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.22 
 
 		 1051 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.8 
 
 		 1043 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.52 
 
 		 1038 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 		 1036 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  34.36 
 
 		 1053 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.42 
 
 		 1062 aa  309  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  34.68 
 
 		 1054 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  34.48 
 
 		 1054 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.66 
 
 		 1469 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  33.51 
 
 		 1032 aa  306  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  34.83 
 
 		 1459 aa  306  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1070 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1070 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1070 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1070 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.23 
 
 		 1029 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 		 1439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.62 
 
 		 1070 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.07 
 
 		 1459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34.01 
 
 		 1062 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  34.5 
 
 		 1049 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1454 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 		 1050 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 		 1048 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.87 
 
 		 1077 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.56 
 
 		 1046 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
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NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  32.67 
 
 		 1031 aa  300  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.3 
 
 		 1083 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  35.03 
 
 		 1061 aa  299  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.71 
 
 		 1053 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.23 
 
 		 1077 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  33.64 
 
 		 1047 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.71 
 
 		 1053 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.71 
 
 		 1053 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
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NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  34.71 
 
 		 1053 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
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