More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1612 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.18 
 
 		 1032 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1010 aa  1999    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.65 
 
 		 1055 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.33 
 
 		 1054 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  37.11 
 
 		 1021 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  38.54 
 
 		 1040 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.86 
 
 		 1040 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  38.18 
 
 		 1079 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.03 
 
 		 1043 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.26 
 
 		 1027 aa  890    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  37.69 
 
 		 1056 aa  697    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  40.04 
 
 		 1050 aa  739    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  40.28 
 
 		 1049 aa  740    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.63 
 
 		 1040 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.33 
 
 		 1054 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  38.53 
 
 		 1063 aa  701    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  36.51 
 
 		 1032 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  35.7 
 
 		 1019 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.77 
 
 		 1056 aa  705    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  39.54 
 
 		 1040 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  34.18 
 
 		 1028 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.23 
 
 		 1031 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.93 
 
 		 1039 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.65 
 
 		 1055 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  36.77 
 
 		 1032 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.23 
 
 		 1031 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  37.15 
 
 		 1083 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  40.78 
 
 		 1050 aa  770    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.69 
 
 		 1056 aa  697    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  39.55 
 
 		 1045 aa  744    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.65 
 
 		 1031 aa  631  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  36 
 
 		 1037 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  35.64 
 
 		 1027 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.47 
 
 		 1046 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  36.97 
 
 		 1029 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.12 
 
 		 1038 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.36 
 
 		 1040 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  36.52 
 
 		 1025 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  35.39 
 
 		 1033 aa  615  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  34.63 
 
 		 1029 aa  611  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  34.22 
 
 		 1034 aa  608  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  33.73 
 
 		 1039 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  32.96 
 
 		 1033 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.38 
 
 		 1025 aa  561  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  33.79 
 
 		 1023 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  33.24 
 
 		 1036 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.19 
 
 		 1049 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  32.66 
 
 		 1038 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  32.62 
 
 		 1070 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  32.2 
 
 		 1083 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  32.65 
 
 		 1062 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  32.62 
 
 		 1070 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  32.32 
 
 		 1033 aa  548  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  32.62 
 
 		 1070 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.2 
 
 		 1051 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.48 
 
 		 1062 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  32.52 
 
 		 1070 aa  546  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33 
 
 		 1064 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  34.22 
 
 		 1038 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  32.07 
 
 		 1070 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.14 
 
 		 1029 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.29 
 
 		 1052 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  33 
 
 		 1031 aa  539  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  31.58 
 
 		 1030 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.43 
 
 		 1043 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  31.58 
 
 		 1039 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  33.3 
 
 		 1032 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.43 
 
 		 1049 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  31.95 
 
 		 1054 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4682  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.98 
 
 		 1049 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.439534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  33.63 
 
 		 1040 aa  535  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.07 
 
 		 1020 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  31.61 
 
 		 1077 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3605  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.98 
 
 		 1049 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584733  normal  0.967685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  30.38 
 
 		 1032 aa  532  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.37 
 
 		 1462 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  32.87 
 
 		 1045 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  32.87 
 
 		 1047 aa  532  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.38 
 
 		 1063 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.23 
 
 		 1060 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.69 
 
 		 1439 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  34.25 
 
 		 1049 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  31.48 
 
 		 1077 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  32.67 
 
 		 1034 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  31.63 
 
 		 1455 aa  528  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  31.48 
 
 		 1077 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  32.15 
 
 		 1051 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  31.48 
 
 		 1077 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  32.18 
 
 		 1063 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  31.29 
 
 		 1077 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.02 
 
 		 1042 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  31.43 
 
 		 1062 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  31.52 
 
 		 1083 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  31.23 
 
 		 1040 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.36 
 
 		 1034 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.21 
 
 		 1034 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  31.19 
 
 		 1077 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  33.87 
 
 		 1036 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  31.19 
 
 		 1077 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  31.19 
 
 		 1077 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>