More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1767 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  37.43 
 
 
1034 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  39.05 
 
 
1077 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.1 
 
 
1034 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.59 
 
 
1053 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  37.13 
 
 
1048 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  43.47 
 
 
1021 aa  796    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  38.42 
 
 
1032 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  37.81 
 
 
1033 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1033 aa  2068    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  37.46 
 
 
1048 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.15 
 
 
1039 aa  791    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.38 
 
 
1060 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  38.37 
 
 
1038 aa  716    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  37.9 
 
 
1064 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  37.55 
 
 
1032 aa  723    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  38.1 
 
 
1032 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  37.73 
 
 
1061 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.97 
 
 
1053 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.86 
 
 
1077 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  38.2 
 
 
1049 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  38.01 
 
 
1052 aa  677    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.55 
 
 
1054 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.52 
 
 
1034 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  39.35 
 
 
1033 aa  704    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  42.51 
 
 
1029 aa  803    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.59 
 
 
1053 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  36.99 
 
 
1040 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.95 
 
 
1077 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  37.03 
 
 
1048 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 
1459 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.73 
 
 
1039 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.22 
 
 
1051 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  38.14 
 
 
1075 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.19 
 
 
1034 aa  688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.95 
 
 
1077 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  37.12 
 
 
1059 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.14 
 
 
1040 aa  758    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 
1070 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  38.54 
 
 
1050 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 
1070 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  39.05 
 
 
1077 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.9 
 
 
1045 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.59 
 
 
1053 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.03 
 
 
1040 aa  746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.61 
 
 
1025 aa  791    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.17 
 
 
1050 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 
1070 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  39.05 
 
 
1077 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  37.43 
 
 
1034 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.96 
 
 
1051 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 
1053 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  38.43 
 
 
1057 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  35.96 
 
 
1037 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  37.04 
 
 
1029 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.07 
 
 
1031 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.95 
 
 
1077 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.51 
 
 
1019 aa  781    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  39.02 
 
 
1030 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  39.54 
 
 
1077 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  37.22 
 
 
1048 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.98 
 
 
1051 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.08 
 
 
1063 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  43.85 
 
 
1028 aa  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.55 
 
 
1042 aa  716    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  38.64 
 
 
1070 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.42 
 
 
1031 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  56.24 
 
 
1034 aa  1144    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  40.29 
 
 
1032 aa  764    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  37.29 
 
 
1031 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.96 
 
 
1029 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.49 
 
 
1040 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.16 
 
 
1052 aa  688    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  38.02 
 
 
1083 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  40.19 
 
 
1040 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 
1070 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.07 
 
 
1031 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  37.9 
 
 
1070 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  37.94 
 
 
1056 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 
1062 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  37.15 
 
 
1045 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2300  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.56 
 
 
1070 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.94 
 
 
1069 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  37.01 
 
 
1072 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  36.73 
 
 
1061 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 
1050 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.98 
 
 
1063 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  38.83 
 
 
1034 aa  747    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.28 
 
 
1034 aa  687    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.93 
 
 
1056 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  38.15 
 
 
1043 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  35.45 
 
 
1045 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  38.42 
 
 
1039 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  38.21 
 
 
1027 aa  699    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.21 
 
 
1054 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  37.72 
 
 
1062 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 
1036 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  38.54 
 
 
1070 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2346  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.08 
 
 
1071 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.752496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.41 
 
 
1038 aa  778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
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NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  37.32 
 
 
1063 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal 
 
 
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