More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2989 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.06 
 
 		 1031 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  100 
 
 		 1040 aa  2075    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.72 
 
 		 1021 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.19 
 
 		 1056 aa  1367    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  62.09 
 
 		 1049 aa  1287    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.41 
 
 		 1039 aa  806    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.91 
 
 		 1038 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.72 
 
 		 1054 aa  1035    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.55 
 
 		 1051 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.51 
 
 		 1046 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.05 
 
 		 1439 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.58 
 
 		 1459 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.71 
 
 		 1033 aa  706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.61 
 
 		 1029 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.72 
 
 		 1054 aa  1035    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.48 
 
 		 1038 aa  756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.7 
 
 		 1052 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.66 
 
 		 1039 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.55 
 
 		 1025 aa  701    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.33 
 
 		 1028 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  71.29 
 
 		 1050 aa  1481    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1010 aa  748    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.18 
 
 		 1037 aa  771    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3449  putative cation/heavy metal efflux system protein  83.83 
 
 		 547 aa  883    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622093  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  39.18 
 
 		 1032 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.35 
 
 		 1031 aa  718    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.35 
 
 		 1031 aa  718    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  41.71 
 
 		 1019 aa  744    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  66.38 
 
 		 1056 aa  1364    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  49.48 
 
 		 1079 aa  1035    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  86.43 
 
 		 1040 aa  1806    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.23 
 
 		 1043 aa  789    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.53 
 
 		 1055 aa  1035    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.06 
 
 		 1040 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.3 
 
 		 1040 aa  762    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  42.5 
 
 		 1029 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.4 
 
 		 1040 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3452  putative cation/heavy metal efflux system protein  83.6 
 
 		 514 aa  867    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.19 
 
 		 1032 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.61 
 
 		 1040 aa  1775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  49.4 
 
 		 1063 aa  979    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.71 
 
 		 1025 aa  711    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.38 
 
 		 1056 aa  1364    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.61 
 
 		 1462 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.54 
 
 		 1049 aa  678    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  71.92 
 
 		 1050 aa  1522    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  48.49 
 
 		 1083 aa  1003    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.58 
 
 		 1027 aa  739    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  50.82 
 
 		 1045 aa  1077    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  40.69 
 
 		 1027 aa  763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  39.73 
 
 		 1034 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.53 
 
 		 1055 aa  1034    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.1 
 
 		 1458 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  40.75 
 
 		 1032 aa  755    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.59 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37 
 
 		 1054 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.44 
 
 		 1455 aa  633  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  37.48 
 
 		 1033 aa  630  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.59 
 
 		 1077 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.95 
 
 		 1075 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.59 
 
 		 1077 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1077 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.31 
 
 		 1034 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  37.09 
 
 		 1039 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.33 
 
 		 1034 aa  628  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  35.96 
 
 		 1032 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.97 
 
 		 1064 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  37.31 
 
 		 1077 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.61 
 
 		 1059 aa  628  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.87 
 
 		 1050 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.41 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.41 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.97 
 
 		 1450 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.36 
 
 		 1032 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.41 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.89 
 
 		 1043 aa  629  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.88 
 
 		 1042 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  35.84 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1238  CzcA family heavy metal efflux protein  38.7 
 
 		 1057 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.43 
 
 		 1469 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.57 
 
 		 1062 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  36.34 
 
 		 1036 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  37.2 
 
 		 1061 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  37.11 
 
 		 1070 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5715  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.31 
 
 		 1045 aa  621  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.55 
 
 		 1063 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.18 
 
 		 1480 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.59 
 
 		 1062 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.01 
 
 		 1070 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.03 
 
 		 1034 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.01 
 
 		 1070 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.11 
 
 		 1070 aa  619  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.55 
 
 		 1063 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.11 
 
 		 1070 aa  619  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.2 
 
 		 1053 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
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NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.2 
 
 		 1053 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
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NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.86 
 
 		 1049 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.2 
 
 		 1053 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
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NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.14 
 
 		 1034 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.86 
 
 		 1065 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
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