More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1875 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  39.15 
 
 		 1034 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  35.74 
 
 		 1045 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.86 
 
 		 1034 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  39.04 
 
 		 1053 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  40.29 
 
 		 1048 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  44.79 
 
 		 1021 aa  831    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.98 
 
 		 1032 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  40.08 
 
 		 1033 aa  726    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  41.72 
 
 		 1033 aa  800    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  40.44 
 
 		 1025 aa  735    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  37.97 
 
 		 1032 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  39.11 
 
 		 1077 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  39.66 
 
 		 1049 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  39.65 
 
 		 1038 aa  748    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  39.64 
 
 		 1064 aa  716    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  37.82 
 
 		 1038 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  37.33 
 
 		 1066 aa  653    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  37.5 
 
 		 1075 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  40.42 
 
 		 1053 aa  730    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  39.02 
 
 		 1077 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  40.76 
 
 		 1049 aa  751    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  40 
 
 		 1052 aa  727    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  40.4 
 
 		 1054 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  41.39 
 
 		 1036 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  41.38 
 
 		 1033 aa  735    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1029 aa  2064    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  38.45 
 
 		 1032 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 		 1062 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  39.85 
 
 		 1061 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  40.21 
 
 		 1048 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  37.39 
 
 		 1070 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  63.53 
 
 		 1039 aa  1296    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  40.12 
 
 		 1038 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  39.6 
 
 		 1075 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  40.65 
 
 		 1059 aa  732    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  38.37 
 
 		 1066 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  38.82 
 
 		 1050 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  37.39 
 
 		 1070 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  39.39 
 
 		 1077 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  41.62 
 
 		 1045 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  37.42 
 
 		 1047 aa  663    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  38.99 
 
 		 1062 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  39.98 
 
 		 1050 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 		 1046 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  39.1 
 
 		 1070 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  35.65 
 
 		 1045 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.74 
 
 		 1034 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  38.73 
 
 		 1028 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  38.21 
 
 		 1065 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 		 1047 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  36.57 
 
 		 1076 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.98 
 
 		 1054 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  38.74 
 
 		 1040 aa  685    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1045 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  45.14 
 
 		 1019 aa  866    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1058 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  39.85 
 
 		 1077 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  39.58 
 
 		 1022 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  38.72 
 
 		 1047 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  39.08 
 
 		 1040 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  36.78 
 
 		 1083 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  39.69 
 
 		 1040 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  42.53 
 
 		 1032 aa  794    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  40.06 
 
 		 1043 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  39.37 
 
 		 1038 aa  686    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  37.87 
 
 		 1070 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  40.31 
 
 		 1031 aa  732    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  42.81 
 
 		 1029 aa  745    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  38.32 
 
 		 1040 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  39.79 
 
 		 1046 aa  710    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  38.48 
 
 		 1083 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  39.39 
 
 		 1077 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  37.26 
 
 		 1070 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  38.07 
 
 		 1070 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 		 1056 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  37.34 
 
 		 1062 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  39.11 
 
 		 1077 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  37.49 
 
 		 1065 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.45 
 
 		 1069 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  38.75 
 
 		 1072 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  37.64 
 
 		 1066 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  38.43 
 
 		 1079 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  38.93 
 
 		 1050 aa  685    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  39.96 
 
 		 1063 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  39.1 
 
 		 1070 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  39.11 
 
 		 1077 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  40.77 
 
 		 1023 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  40.36 
 
 		 1043 aa  748    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  39.89 
 
 		 1040 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  40.77 
 
 		 1045 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  39.19 
 
 		 1039 aa  730    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.86 
 
 		 1027 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  37.45 
 
 		 1455 aa  679    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  38.77 
 
 		 1075 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  39.23 
 
 		 1045 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  37.09 
 
 		 1078 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  39.39 
 
 		 1077 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  39.1 
 
 		 1070 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  59.01 
 
 		 1028 aa  1201    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  38.11 
 
 		 1037 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>