More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5329 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  34.98 
 
 		 1034 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.89 
 
 		 1053 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  35.68 
 
 		 1034 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.89 
 
 		 1053 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  35.75 
 
 		 1032 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.81 
 
 		 1021 aa  781    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.95 
 
 		 1043 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.49 
 
 		 1033 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.42 
 
 		 1033 aa  719    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  42.25 
 
 		 1032 aa  829    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.43 
 
 		 1034 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.33 
 
 		 1047 aa  676    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  85.29 
 
 		 1038 aa  1788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  37.62 
 
 		 1064 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  38.07 
 
 		 1070 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  64.36 
 
 		 1030 aa  1309    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.09 
 
 		 1051 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.21 
 
 		 1062 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.31 
 
 		 1053 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  38.28 
 
 		 1049 aa  704    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  38.08 
 
 		 1052 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  37.2 
 
 		 1054 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.08 
 
 		 1459 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.95 
 
 		 1033 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.19 
 
 		 1029 aa  742    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.23 
 
 		 1051 aa  777    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.8 
 
 		 1053 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  41 
 
 		 1025 aa  749    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.63 
 
 		 1039 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.67 
 
 		 1063 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.37 
 
 		 1075 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.52 
 
 		 1032 aa  721    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  37.71 
 
 		 1059 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1028 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.4 
 
 		 1045 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.55 
 
 		 1031 aa  692    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.54 
 
 		 1034 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.84 
 
 		 1054 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.86 
 
 		 1050 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.19 
 
 		 1060 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.88 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  35.58 
 
 		 1034 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.56 
 
 		 1034 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.61 
 
 		 1038 aa  709    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.93 
 
 		 1034 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.65 
 
 		 1037 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.98 
 
 		 1033 aa  1007    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37.61 
 
 		 1040 aa  658    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.74 
 
 		 1019 aa  793    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2297  CzcA family heavy metal efflux protein  36.34 
 
 		 1080 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.38 
 
 		 1052 aa  669    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.58 
 
 		 1040 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.92 
 
 		 1062 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.96 
 
 		 1040 aa  711    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  37.89 
 
 		 1053 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.1 
 
 		 1039 aa  720    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  37.27 
 
 		 1031 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.43 
 
 		 1029 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.43 
 
 		 1040 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.24 
 
 		 1462 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  37.06 
 
 		 1083 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  39.48 
 
 		 1036 aa  772    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  37.54 
 
 		 1029 aa  675    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.02 
 
 		 1031 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.08 
 
 		 1034 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.71 
 
 		 1046 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  64.76 
 
 		 1057 aa  1274    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  37.79 
 
 		 1032 aa  724    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.55 
 
 		 1031 aa  692    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.25 
 
 		 1025 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  37.26 
 
 		 1079 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  37.38 
 
 		 1050 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.58 
 
 		 1063 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.97 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.02 
 
 		 1458 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  37.93 
 
 		 1043 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  35.58 
 
 		 1045 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  100 
 
 		 1039 aa  2092    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  38.93 
 
 		 1027 aa  709    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 		 1459 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  67.61 
 
 		 1042 aa  1394    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  38.07 
 
 		 1070 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  38.07 
 
 		 1070 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.39 
 
 		 1032 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.8 
 
 		 1049 aa  641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.44 
 
 		 1077 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  37.7 
 
 		 1050 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.44 
 
 		 1077 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.44 
 
 		 1077 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.06 
 
 		 1450 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1077 aa  632  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.17 
 
 		 1062 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  36.53 
 
 		 1083 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  38.02 
 
 		 1061 aa  627  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  37.1 
 
 		 1048 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  37.57 
 
 		 1040 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
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