More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0536 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  88.97 
 
 
1034 aa  1828    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  37.43 
 
 
1045 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  84.33 
 
 
1034 aa  1710    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  43.9 
 
 
1053 aa  894    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  43.73 
 
 
1048 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  35.31 
 
 
1052 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  40.39 
 
 
1021 aa  756    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  48.3 
 
 
1032 aa  959    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  47.2 
 
 
1033 aa  962    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  37.52 
 
 
1033 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  37.54 
 
 
1066 aa  708    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  38.25 
 
 
1032 aa  705    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  41.9 
 
 
1016 aa  771    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  46.7 
 
 
1049 aa  914    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.15 
 
 
1038 aa  717    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  43.19 
 
 
1064 aa  868    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  37.73 
 
 
1024 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  40.31 
 
 
1038 aa  759    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  40.64 
 
 
1066 aa  796    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  38.75 
 
 
1075 aa  763    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  43.83 
 
 
1053 aa  877    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  44.46 
 
 
1077 aa  884    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  35.29 
 
 
1066 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.3 
 
 
1071 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  36.03 
 
 
1047 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  44.75 
 
 
1049 aa  894    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  44.21 
 
 
1052 aa  869    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  35.4 
 
 
1066 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  43.83 
 
 
1054 aa  880    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  45.92 
 
 
1036 aa  900    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 
1033 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 
1029 aa  747    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  42.79 
 
 
1032 aa  838    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  37.14 
 
 
1051 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  35.9 
 
 
1044 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  43.57 
 
 
1032 aa  837    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  41.21 
 
 
1028 aa  744    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  38.39 
 
 
1039 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  48.31 
 
 
1038 aa  939    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  45.68 
 
 
1075 aa  908    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  40.06 
 
 
1037 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  40.08 
 
 
1023 aa  712    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  44.53 
 
 
1059 aa  880    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  44.56 
 
 
1066 aa  849    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  44.74 
 
 
1077 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  48.02 
 
 
1045 aa  942    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  42.4 
 
 
1047 aa  843    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  41.56 
 
 
1062 aa  847    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  44.54 
 
 
1050 aa  902    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  35.01 
 
 
1074 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  44.21 
 
 
1070 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  36.85 
 
 
1045 aa  722    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  88.78 
 
 
1034 aa  1790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  39.67 
 
 
1028 aa  760    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  39.89 
 
 
1065 aa  811    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  40.15 
 
 
1064 aa  774    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  39.21 
 
 
1037 aa  745    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  37.05 
 
 
1021 aa  729    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  45.74 
 
 
1040 aa  941    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  34.97 
 
 
1059 aa  674    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  41.43 
 
 
1019 aa  816    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  42.67 
 
 
1058 aa  806    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  44.4 
 
 
1077 aa  873    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  45.82 
 
 
1022 aa  847    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  36.25 
 
 
1051 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  36.01 
 
 
1040 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  41.05 
 
 
1026 aa  746    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  39.07 
 
 
1083 aa  764    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  36.18 
 
 
1043 aa  676    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  41.95 
 
 
1043 aa  821    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  40.67 
 
 
1038 aa  807    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  36.61 
 
 
1052 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  46.9 
 
 
1031 aa  978    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.02 
 
 
1029 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  44.73 
 
 
1040 aa  877    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  43.61 
 
 
1046 aa  851    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  34.48 
 
 
1056 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  43.77 
 
 
1083 aa  881    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  38.05 
 
 
1077 aa  733    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  44.36 
 
 
1070 aa  869    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  36.61 
 
 
1043 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  42.54 
 
 
1070 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  44.34 
 
 
1056 aa  860    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  41.61 
 
 
1026 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  36.32 
 
 
1060 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  36.28 
 
 
1065 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  43.46 
 
 
1069 aa  864    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  44.75 
 
 
1072 aa  864    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  35.26 
 
 
1060 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  41.85 
 
 
1079 aa  814    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  35.63 
 
 
1050 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  44.76 
 
 
1063 aa  886    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  37.08 
 
 
1076 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  38.11 
 
 
1076 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  46.9 
 
 
1023 aa  945    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  45.08 
 
 
1043 aa  900    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  35.48 
 
 
1045 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.43 
 
 
1039 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  36.17 
 
 
1027 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  38.38 
 
 
1075 aa  733    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>