More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1341 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  37.3 
 
 
1034 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.29 
 
 
1031 aa  772    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.12 
 
 
1034 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.85 
 
 
1053 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  39.19 
 
 
1034 aa  730    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 
1446 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  42.68 
 
 
1021 aa  835    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  36.52 
 
 
1032 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.3 
 
 
1033 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  39.15 
 
 
1033 aa  778    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.27 
 
 
1077 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 
1032 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.27 
 
 
1077 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  35.69 
 
 
1040 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.03 
 
 
1038 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.03 
 
 
1064 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.69 
 
 
1063 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.76 
 
 
1053 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.36 
 
 
1077 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  36.21 
 
 
1030 aa  721    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.14 
 
 
1053 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.17 
 
 
1077 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.9 
 
 
1034 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.44 
 
 
1049 aa  689    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.23 
 
 
1052 aa  662    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.9 
 
 
1054 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  35.56 
 
 
1051 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.12 
 
 
1033 aa  766    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  42.07 
 
 
1029 aa  802    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.05 
 
 
1032 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.62 
 
 
1056 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  61.46 
 
 
1032 aa  1269    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  35.96 
 
 
1032 aa  670    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.27 
 
 
1077 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  39.9 
 
 
1039 aa  761    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.61 
 
 
1075 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.12 
 
 
1059 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  36.73 
 
 
1459 aa  674    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  41.4 
 
 
1050 aa  795    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.58 
 
 
1456 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.36 
 
 
1077 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.63 
 
 
1045 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  36.62 
 
 
1047 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  36.09 
 
 
1062 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.31 
 
 
1069 aa  641    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.33 
 
 
1050 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.87 
 
 
1070 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.22 
 
 
1029 aa  653    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  37.78 
 
 
1034 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  51.31 
 
 
1034 aa  1095    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  33.77 
 
 
1065 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.89 
 
 
1034 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.36 
 
 
1077 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  36.04 
 
 
1040 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.98 
 
 
1079 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  42.97 
 
 
1019 aa  847    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  36.37 
 
 
1057 aa  676    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.12 
 
 
1077 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  41.82 
 
 
1056 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.85 
 
 
1025 aa  770    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  42.1 
 
 
1040 aa  814    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  35.61 
 
 
1070 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  41.41 
 
 
1040 aa  790    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 
1010 aa  663    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  34.85 
 
 
1053 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 
1070 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  37.68 
 
 
1032 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.51 
 
 
1031 aa  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.57 
 
 
1029 aa  763    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  34.64 
 
 
1040 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.65 
 
 
1046 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 
1070 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.99 
 
 
1083 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.44 
 
 
1055 aa  758    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.87 
 
 
1054 aa  765    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  57.21 
 
 
1032 aa  1234    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.85 
 
 
1053 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  39.75 
 
 
1063 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.21 
 
 
1062 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  34.96 
 
 
1061 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.87 
 
 
1054 aa  765    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  35.89 
 
 
1069 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.96 
 
 
1040 aa  810    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  38.17 
 
 
1083 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  39.75 
 
 
1025 aa  747    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  41.72 
 
 
1050 aa  832    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  35.59 
 
 
1063 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  41.83 
 
 
1049 aa  818    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  34.95 
 
 
1054 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.46 
 
 
1027 aa  707    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.76 
 
 
1043 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
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NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  40.08 
 
 
1045 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.1 
 
 
1039 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.44 
 
 
1027 aa  790    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.02 
 
 
1033 aa  658    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0323863 
 
 
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NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  37.51 
 
 
1455 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
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NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  41.46 
 
 
1028 aa  807    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.74 
 
 
1046 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.71 
 
 
1070 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  37.13 
 
 
1036 aa  728    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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